46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3009 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 		 931 aa  1892    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  66.81 
 
 		 929 aa  1213    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  51.77 
 
 		 955 aa  904    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  46.56 
 
 		 943 aa  792    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  27.37 
 
 		 909 aa  185  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  27.31 
 
 		 906 aa  184  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  27.02 
 
 		 896 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  24.75 
 
 		 894 aa  167  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  25.73 
 
 		 892 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  47.48 
 
 		 895 aa  137  9e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  23.74 
 
 		 877 aa  127  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  27.71 
 
 		 633 aa  124  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  27.86 
 
 		 633 aa  121  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  27.3 
 
 		 633 aa  120  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  38.41 
 
 		 889 aa  97.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  39.06 
 
 		 884 aa  95.9  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  40.68 
 
 		 883 aa  95.9  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  40.51 
 
 		 428 aa  95.9  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  38.84 
 
 		 853 aa  95.1  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  35.98 
 
 		 916 aa  91.7  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  35.98 
 
 		 937 aa  91.7  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  34.55 
 
 		 966 aa  90.5  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  30.48 
 
 		 894 aa  89  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  30.48 
 
 		 894 aa  89  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  38.76 
 
 		 888 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  42.02 
 
 		 1028 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  33.53 
 
 		 972 aa  85.1  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  41.6 
 
 		 897 aa  84.7  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  32.93 
 
 		 992 aa  82.8  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  35.66 
 
 		 617 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  39.36 
 
 		 995 aa  80.9  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  32.09 
 
 		 938 aa  80.9  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4332  AAA-4 family protein  25.87 
 
 		 777 aa  78.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  35.97 
 
 		 1011 aa  76.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  30.95 
 
 		 990 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1312  AAA-4 family protein  25.27 
 
 		 774 aa  68.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201459  normal  0.370509 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  37.04 
 
 		 145 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  37.04 
 
 		 145 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1641  AAA-4 family protein  24.76 
 
 		 773 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.49775  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1391  putative transcriptional regulator  24.15 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1646  AAA-4 family protein  26.53 
 
 		 770 aa  62  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02287  PHP domain protein  36.78 
 
 		 297 aa  44.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.624872  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1463  phosphotransferase domain-containing protein  36 
 
 		 286 aa  44.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.07 
 
 		 568 aa  44.7  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1529  phosphotransferase domain-containing protein  36 
 
 		 286 aa  44.3  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70197  normal  0.0178812 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3017  TrpH family protein  36 
 
 		 286 aa  44.3  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>