43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3605 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  51.77 
 
 		 931 aa  895    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  47.69 
 
 		 929 aa  815    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 955 aa  1951    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  51.85 
 
 		 943 aa  935    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  25.61 
 
 		 895 aa  228  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  26.79 
 
 		 896 aa  184  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  25.74 
 
 		 892 aa  156  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  23.18 
 
 		 883 aa  155  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  26.15 
 
 		 894 aa  149  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  26.15 
 
 		 894 aa  149  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  23.29 
 
 		 889 aa  124  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  25.18 
 
 		 633 aa  123  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  25.66 
 
 		 633 aa  121  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  25.51 
 
 		 633 aa  118  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  24.24 
 
 		 877 aa  106  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  44.26 
 
 		 853 aa  106  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  40.26 
 
 		 909 aa  101  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  47.41 
 
 		 906 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  42.45 
 
 		 894 aa  100  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  37.22 
 
 		 428 aa  95.9  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  37.97 
 
 		 897 aa  94.7  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  40 
 
 		 888 aa  92.8  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  27.59 
 
 		 1028 aa  88.6  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  39.02 
 
 		 884 aa  88.2  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  32.8 
 
 		 916 aa  86.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  32.8 
 
 		 937 aa  86.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  39.39 
 
 		 617 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  32.41 
 
 		 992 aa  86.3  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  30.23 
 
 		 966 aa  85.5  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  41.18 
 
 		 1028 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  32.64 
 
 		 972 aa  84.7  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  33.33 
 
 		 1011 aa  79.3  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  24.48 
 
 		 938 aa  78.6  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  33.88 
 
 		 995 aa  74.3  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  31.08 
 
 		 990 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4332  AAA-4 family protein  29.21 
 
 		 777 aa  65.1  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1391  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 		 586 aa  63.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  32.08 
 
 		 145 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  32.08 
 
 		 145 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1646  AAA-4 family protein  25.72 
 
 		 770 aa  59.3  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1312  AAA-4 family protein  24.04 
 
 		 774 aa  55.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201459  normal  0.370509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1641  AAA-4 family protein  23.93 
 
 		 773 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.49775  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  29.14 
 
 		 1174 aa  46.2  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>