42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2437 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  866    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  48.14 
 
 		 992 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  45.2 
 
 		 990 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  36.18 
 
 		 937 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  36.18 
 
 		 916 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  36.36 
 
 		 1028 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  46.31 
 
 		 1028 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  39.58 
 
 		 966 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  50.74 
 
 		 853 aa  126  9e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  45.22 
 
 		 897 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  45.33 
 
 		 888 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  32.5 
 
 		 995 aa  116  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  45.14 
 
 		 894 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  42.25 
 
 		 1011 aa  107  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  39.86 
 
 		 938 aa  103  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  40.43 
 
 		 972 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  34.46 
 
 		 955 aa  90.9  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  41.22 
 
 		 943 aa  90.5  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  39.39 
 
 		 895 aa  90.1  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  44.76 
 
 		 931 aa  88.6  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  42.86 
 
 		 929 aa  86.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  37.88 
 
 		 877 aa  82.8  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  39.5 
 
 		 145 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  39.5 
 
 		 145 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  38.17 
 
 		 906 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  34.75 
 
 		 889 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  35.88 
 
 		 909 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  38.1 
 
 		 884 aa  76.6  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  39.68 
 
 		 883 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  38.58 
 
 		 633 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  38.58 
 
 		 633 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  38.58 
 
 		 633 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  36.43 
 
 		 892 aa  72.8  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  34.88 
 
 		 896 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  34.65 
 
 		 894 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  34.65 
 
 		 894 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  33.1 
 
 		 617 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1243  hypothetical protein  37.66 
 
 		 743 aa  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  32.18 
 
 		 448 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  32.18 
 
 		 448 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  31.88 
 
 		 585 aa  43.9  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  34.57 
 
 		 369 aa  43.5  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>