44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1891 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  100 
 
 		 877 aa  1798    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  81.28 
 
 		 889 aa  1492    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  28.4 
 
 		 909 aa  281  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  29.35 
 
 		 906 aa  270  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  25.48 
 
 		 896 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  25.24 
 
 		 892 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  26.68 
 
 		 884 aa  180  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  25.37 
 
 		 894 aa  177  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  25.37 
 
 		 894 aa  177  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  24.8 
 
 		 883 aa  158  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  25.34 
 
 		 894 aa  152  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  25.11 
 
 		 633 aa  132  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  26.34 
 
 		 943 aa  124  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  23.33 
 
 		 931 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  34.52 
 
 		 1011 aa  103  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  22.19 
 
 		 1028 aa  97.8  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  22.72 
 
 		 853 aa  95.9  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  42.4 
 
 		 895 aa  94.7  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  38.52 
 
 		 897 aa  90.9  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  38.81 
 
 		 888 aa  90.5  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  42.24 
 
 		 633 aa  89.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  42.24 
 
 		 633 aa  89.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  34.91 
 
 		 145 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  34.91 
 
 		 145 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  29.34 
 
 		 1028 aa  87  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  25.93 
 
 		 995 aa  85.5  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  29.61 
 
 		 966 aa  83.2  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  37.88 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  41.94 
 
 		 955 aa  82.4  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  44.09 
 
 		 929 aa  81.3  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  32.47 
 
 		 992 aa  76.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  31.74 
 
 		 972 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  36.51 
 
 		 617 aa  70.9  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  31.91 
 
 		 990 aa  66.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  28.97 
 
 		 938 aa  57  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0235  hypothetical protein  23.03 
 
 		 713 aa  53.9  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 		 1194 aa  48.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  24.22 
 
 		 1217 aa  47.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0456  phosphotransferase domain-containing protein  33.71 
 
 		 679 aa  47.8  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.358651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  27.15 
 
 		 1195 aa  47.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3141  phosphotransferase domain-containing protein  37.36 
 
 		 240 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0822  SMC protein-like protein  28.31 
 
 		 1100 aa  45.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.866363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  36.99 
 
 		 987 aa  44.3  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2338  phosphotransferase domain-containing protein  35.16 
 
 		 241 aa  44.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.885404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>