40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0676 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  100 
 
 		 897 aa  1855    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  44.88 
 
 		 888 aa  794    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  34.11 
 
 		 853 aa  385  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  24.36 
 
 		 1028 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1243  hypothetical protein  30.4 
 
 		 743 aa  145  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  28.98 
 
 		 995 aa  134  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  30.53 
 
 		 992 aa  130  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  45.22 
 
 		 428 aa  119  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  40 
 
 		 937 aa  118  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  40 
 
 		 916 aa  118  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  25.53 
 
 		 972 aa  112  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  27.01 
 
 		 938 aa  105  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  29.33 
 
 		 990 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  41.01 
 
 		 894 aa  103  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  39.16 
 
 		 1028 aa  101  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  26.79 
 
 		 966 aa  101  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  41.33 
 
 		 894 aa  93.2  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  41.33 
 
 		 894 aa  93.2  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  38.52 
 
 		 877 aa  90.5  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  41.1 
 
 		 896 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  37.97 
 
 		 955 aa  89  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  42.11 
 
 		 943 aa  88.2  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  33.57 
 
 		 1011 aa  88.2  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  43.94 
 
 		 892 aa  87.8  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  39.37 
 
 		 895 aa  85.9  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  36.23 
 
 		 889 aa  85.5  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  39.84 
 
 		 617 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  39.53 
 
 		 906 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  38.76 
 
 		 909 aa  82.8  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  42.72 
 
 		 929 aa  80.9  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  42.72 
 
 		 931 aa  80.1  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  38.81 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  38.06 
 
 		 633 aa  77.4  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  38.35 
 
 		 633 aa  77  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  37.06 
 
 		 883 aa  77.4  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  38.28 
 
 		 884 aa  75.5  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  33.94 
 
 		 145 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  33.94 
 
 		 145 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1522  hypothetical protein  28.18 
 
 		 709 aa  47.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.541364  hitchhiker  0.00000000000000176755 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5585  hypothetical protein  28.32 
 
 		 258 aa  44.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0168828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>