40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_12740 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  100 
 
 
938 aa  1924    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  26.49 
 
 
966 aa  265  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  33.26 
 
 
995 aa  235  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1243  hypothetical protein  27.27 
 
 
743 aa  200  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  26.58 
 
 
888 aa  138  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  26.42 
 
 
992 aa  127  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  28.45 
 
 
897 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  28 
 
 
990 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  36.31 
 
 
972 aa  112  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  40.69 
 
 
428 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  38.3 
 
 
853 aa  95.1  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  31.21 
 
 
895 aa  90.5  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  24.57 
 
 
1028 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  24.95 
 
 
1028 aa  87.4  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  37.06 
 
 
894 aa  84  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  26.38 
 
 
1011 aa  82  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  26.24 
 
 
937 aa  80.9  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  26.49 
 
 
916 aa  78.6  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  36.21 
 
 
955 aa  75.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  30.81 
 
 
931 aa  74.7  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  34.06 
 
 
145 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  34.06 
 
 
145 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  35 
 
 
883 aa  72.4  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  34.29 
 
 
906 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  34.29 
 
 
909 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  23.62 
 
 
889 aa  68.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  35.29 
 
 
896 aa  68.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  28.09 
 
 
943 aa  68.2  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  35.9 
 
 
892 aa  66.2  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  29.65 
 
 
929 aa  65.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  32.41 
 
 
633 aa  65.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  34.19 
 
 
894 aa  64.3  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  34.19 
 
 
894 aa  64.3  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  31.72 
 
 
633 aa  63.9  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  31.72 
 
 
633 aa  64.3  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  23.75 
 
 
884 aa  57.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  30 
 
 
877 aa  57.4  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  34.15 
 
 
617 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  29.63 
 
 
225 aa  48.9  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3737  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.47 
 
 
526 aa  47  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>