44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3041 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  100 
 
 		 1028 aa  2105    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  66.93 
 
 		 1028 aa  1446    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  29.65 
 
 		 995 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  28.82 
 
 		 1011 aa  312  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  26.05 
 
 		 937 aa  216  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  26.08 
 
 		 916 aa  209  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  25.56 
 
 		 992 aa  208  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  24.45 
 
 		 897 aa  180  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  23.16 
 
 		 938 aa  137  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  46.31 
 
 		 428 aa  131  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  26.95 
 
 		 990 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  27.01 
 
 		 966 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  49.58 
 
 		 145 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  49.58 
 
 		 145 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1243  hypothetical protein  26.2 
 
 		 743 aa  108  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  40.77 
 
 		 853 aa  105  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  43.9 
 
 		 895 aa  103  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  26.42 
 
 		 888 aa  98.6  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5585  hypothetical protein  38.85 
 
 		 258 aa  94.7  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0168828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  39.29 
 
 		 894 aa  93.2  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  29.34 
 
 		 877 aa  87  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  31.01 
 
 		 972 aa  85.9  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  29.68 
 
 		 889 aa  83.2  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  38.21 
 
 		 906 aa  80.1  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  38.21 
 
 		 884 aa  79.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  36.3 
 
 		 883 aa  79  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  40.5 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  40.5 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  42.86 
 
 		 943 aa  79  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  39.55 
 
 		 892 aa  77.8  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  42.27 
 
 		 929 aa  77.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  39.67 
 
 		 633 aa  77.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  36.59 
 
 		 909 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  35.46 
 
 		 617 aa  77  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  41.24 
 
 		 931 aa  76.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  40.21 
 
 		 955 aa  73.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  34.65 
 
 		 894 aa  70.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  34.65 
 
 		 894 aa  70.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  35.94 
 
 		 896 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5984  hypothetical protein  27.03 
 
 		 358 aa  52.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0555874 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5581  hypothetical protein  27.03 
 
 		 358 aa  52.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0530357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1045  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.71 
 
 		 1049 aa  45.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  31.11 
 
 		 448 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  31.11 
 
 		 448 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>