39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2772 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  61.49 
 
 		 990 aa  1238    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  100 
 
 		 992 aa  2027    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  32.57 
 
 		 937 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  32.35 
 
 		 916 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  48.14 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  27.24 
 
 		 995 aa  249  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  25.3 
 
 		 1028 aa  218  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  32.15 
 
 		 966 aa  206  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  25.89 
 
 		 972 aa  186  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  30.53 
 
 		 897 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  27.15 
 
 		 1028 aa  125  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1243  hypothetical protein  25.79 
 
 		 743 aa  125  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  29.09 
 
 		 938 aa  124  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  45.8 
 
 		 853 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  42 
 
 		 888 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  32.82 
 
 		 1011 aa  108  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  41.04 
 
 		 894 aa  94  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  32.68 
 
 		 889 aa  86.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  32.41 
 
 		 955 aa  86.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  35.17 
 
 		 895 aa  86.3  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  32.47 
 
 		 877 aa  85.5  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  32.93 
 
 		 931 aa  83.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  32.41 
 
 		 943 aa  81.6  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  36.55 
 
 		 929 aa  80.9  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  39.84 
 
 		 145 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  39.84 
 
 		 145 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  32.03 
 
 		 906 aa  78.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  32.19 
 
 		 909 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  34.97 
 
 		 633 aa  71.2  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  39.02 
 
 		 883 aa  70.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  35.88 
 
 		 633 aa  70.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  37.86 
 
 		 892 aa  69.7  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  35.11 
 
 		 633 aa  69.7  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  36.51 
 
 		 884 aa  66.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  33.11 
 
 		 896 aa  65.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  32.17 
 
 		 617 aa  62.4  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  33.66 
 
 		 894 aa  60.1  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  33.66 
 
 		 894 aa  60.1  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5585  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  55.1  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0168828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>