44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1737 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1261    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  33.18 
 
 		 633 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  33.18 
 
 		 633 aa  296  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  32.23 
 
 		 633 aa  289  9e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  27.15 
 
 		 884 aa  183  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  28.16 
 
 		 909 aa  174  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  26.56 
 
 		 883 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  28.95 
 
 		 892 aa  169  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  26.45 
 
 		 906 aa  157  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  26.62 
 
 		 894 aa  150  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  26.62 
 
 		 894 aa  150  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  25.26 
 
 		 894 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  40.56 
 
 		 895 aa  94.7  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  39.38 
 
 		 896 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  39.02 
 
 		 853 aa  87.8  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  39.84 
 
 		 897 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  36.03 
 
 		 916 aa  80.9  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  36.03 
 
 		 937 aa  80.9  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  35.46 
 
 		 1028 aa  77  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  39.39 
 
 		 955 aa  77  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  36.72 
 
 		 888 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  39.34 
 
 		 943 aa  75.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  33.82 
 
 		 929 aa  74.7  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  35.66 
 
 		 931 aa  74.3  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  36.8 
 
 		 889 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  35.46 
 
 		 1028 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  36.51 
 
 		 877 aa  71.2  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  37.6 
 
 		 995 aa  70.9  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  31.97 
 
 		 1011 aa  68.9  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  30.77 
 
 		 972 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  33.1 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  30.72 
 
 		 966 aa  62  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  35.64 
 
 		 992 aa  58.5  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  33 
 
 		 990 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  33.73 
 
 		 938 aa  50.8  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  37.5 
 
 		 987 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  37.5 
 
 		 987 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1522  hypothetical protein  28.57 
 
 		 709 aa  48.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.541364  hitchhiker  0.00000000000000176755 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  24.01 
 
 		 577 aa  44.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2171  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 539 aa  43.9  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0650343  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  40 
 
 		 1130 aa  43.5  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1354 aa  43.9  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>