36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0840 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  99.89 
 
 		 916 aa  1869    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  100 
 
 		 937 aa  1913    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  32.48 
 
 		 992 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  31.99 
 
 		 990 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  28.57 
 
 		 966 aa  328  3e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  26.13 
 
 		 995 aa  225  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  36.18 
 
 		 428 aa  225  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  26.07 
 
 		 1028 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  25.19 
 
 		 1028 aa  207  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  30.13 
 
 		 972 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  25.54 
 
 		 1011 aa  172  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  29.75 
 
 		 853 aa  132  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  35.68 
 
 		 888 aa  122  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1243  hypothetical protein  25.15 
 
 		 743 aa  121  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  41.21 
 
 		 897 aa  118  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  40.31 
 
 		 895 aa  95.5  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  35.66 
 
 		 894 aa  94  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  28.13 
 
 		 633 aa  91.7  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  30.65 
 
 		 909 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  33.73 
 
 		 906 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  23.57 
 
 		 943 aa  83.2  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  30.6 
 
 		 955 aa  82.4  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  32.18 
 
 		 889 aa  82  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  35.98 
 
 		 931 aa  82  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  38.24 
 
 		 884 aa  80.5  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  36.03 
 
 		 617 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  35.98 
 
 		 929 aa  80.9  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  35.77 
 
 		 883 aa  80.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  34.88 
 
 		 145 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  34.88 
 
 		 145 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  25.93 
 
 		 938 aa  78.2  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  37.78 
 
 		 892 aa  75.1  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  40 
 
 		 896 aa  74.7  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  36.76 
 
 		 894 aa  67.4  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  36.76 
 
 		 894 aa  67.4  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5585  hypothetical protein  29.75 
 
 		 258 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0168828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>