63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2865 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  100 
 
 		 883 aa  1803    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  42.58 
 
 		 884 aa  747    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  33.89 
 
 		 896 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  33.96 
 
 		 892 aa  489  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  31.78 
 
 		 894 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  31.78 
 
 		 894 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  30.2 
 
 		 633 aa  228  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  26.3 
 
 		 909 aa  227  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  30.35 
 
 		 633 aa  226  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  30.05 
 
 		 633 aa  223  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  25.36 
 
 		 906 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  24.26 
 
 		 894 aa  181  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  26.56 
 
 		 617 aa  172  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  24.1 
 
 		 889 aa  167  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  25.33 
 
 		 877 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  23.18 
 
 		 955 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  44.54 
 
 		 895 aa  98.6  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  44.09 
 
 		 853 aa  97.1  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  34.78 
 
 		 1011 aa  88.2  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  40.68 
 
 		 931 aa  85.5  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  35.29 
 
 		 929 aa  85.1  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  37.67 
 
 		 972 aa  85.1  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  38.4 
 
 		 943 aa  81.6  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  35.77 
 
 		 937 aa  80.5  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  37.88 
 
 		 888 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  38.18 
 
 		 145 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  38.18 
 
 		 145 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  37.04 
 
 		 1028 aa  80.1  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  35.77 
 
 		 916 aa  80.1  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  36.3 
 
 		 1028 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  37.06 
 
 		 897 aa  77.4  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  39.68 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  35 
 
 		 938 aa  72  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  24.09 
 
 		 966 aa  71.6  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  36.51 
 
 		 995 aa  70.5  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  39.42 
 
 		 992 aa  65.1  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1522  hypothetical protein  31.29 
 
 		 709 aa  63.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.541364  hitchhiker  0.00000000000000176755 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  37 
 
 		 990 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1391  putative transcriptional regulator  23.45 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0235  hypothetical protein  29.55 
 
 		 713 aa  54.3  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0337  PHP-like protein  24.04 
 
 		 236 aa  53.9  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268427  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  24.54 
 
 		 1198 aa  51.2  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  24.33 
 
 		 1206 aa  50.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  24.34 
 
 		 1198 aa  50.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 		 1268 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 		 1170 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 		 1170 aa  48.9  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 		 1202 aa  48.9  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 		 1170 aa  48.9  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 		 1170 aa  48.9  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 		 1200 aa  48.9  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 		 1170 aa  49.3  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 		 1170 aa  48.9  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 		 1170 aa  48.9  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 		 1170 aa  49.3  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0095  PHP domain protein  27.42 
 
 		 251 aa  48.5  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000129632 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 		 1170 aa  48.9  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 		 1170 aa  48.5  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  23.34 
 
 		 1190 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  22.55 
 
 		 1171 aa  45.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0976  ABC transporter ATPase  31.53 
 
 		 516 aa  45.1  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3229  ABC transporter related  38.03 
 
 		 495 aa  44.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3796  phosphotransferase domain-containing protein  28.99 
 
 		 240 aa  44.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>