42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2527 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  81.28 
 
 
877 aa  1477    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  100 
 
 
889 aa  1832    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  27.9 
 
 
909 aa  280  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  29.64 
 
 
906 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  25.95 
 
 
894 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  25.95 
 
 
894 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  26.37 
 
 
884 aa  181  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  24.1 
 
 
883 aa  167  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  24.13 
 
 
892 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  23.01 
 
 
955 aa  112  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  23.66 
 
 
633 aa  111  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  24.38 
 
 
633 aa  109  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  24.06 
 
 
633 aa  110  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  37.97 
 
 
894 aa  102  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  33.95 
 
 
1011 aa  97.8  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  25 
 
 
896 aa  95.9  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  40 
 
 
895 aa  94.4  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  39.42 
 
 
888 aa  92.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  27.62 
 
 
1028 aa  90.1  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  32.86 
 
 
853 aa  89.4  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  45.05 
 
 
931 aa  88.2  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  36.23 
 
 
897 aa  85.5  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  35.85 
 
 
145 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  35.85 
 
 
145 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  29.68 
 
 
1028 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  32.18 
 
 
916 aa  82  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  32.18 
 
 
937 aa  82  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  28.29 
 
 
966 aa  80.9  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  34.75 
 
 
428 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  32.68 
 
 
992 aa  77.4  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  26.11 
 
 
943 aa  74.7  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  36.8 
 
 
617 aa  73.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  24.58 
 
 
995 aa  72.8  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  28.74 
 
 
972 aa  72.4  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  30.2 
 
 
990 aa  64.7  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  30 
 
 
938 aa  59.3  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  22.49 
 
 
929 aa  56.2  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_002950  PG0456  phosphotransferase domain-containing protein  39.33 
 
 
679 aa  50.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.358651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0235  hypothetical protein  22.67 
 
 
713 aa  48.9  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  21.33 
 
 
445 aa  46.2  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0095  PHP domain protein  26.37 
 
 
251 aa  45.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129632 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  27.42 
 
 
258 aa  44.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>