41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1734 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  68.14 
 
 		 909 aa  1239    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 906 aa  1810    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  29.64 
 
 		 889 aa  279  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  29.42 
 
 		 877 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  29.16 
 
 		 892 aa  259  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  29.13 
 
 		 896 aa  258  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  28.91 
 
 		 894 aa  251  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  28.91 
 
 		 894 aa  251  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  25.36 
 
 		 883 aa  223  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  27.85 
 
 		 884 aa  220  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  27.31 
 
 		 931 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  28.11 
 
 		 633 aa  171  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  28.24 
 
 		 633 aa  169  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  27.79 
 
 		 633 aa  167  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  27.12 
 
 		 617 aa  160  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  21.05 
 
 		 895 aa  144  9e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  29.53 
 
 		 894 aa  118  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  43.57 
 
 		 929 aa  102  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  49.17 
 
 		 943 aa  91.7  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  41.8 
 
 		 1011 aa  90.5  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  30.41 
 
 		 853 aa  89  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  37.98 
 
 		 888 aa  86.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  47.41 
 
 		 955 aa  84.7  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  39.53 
 
 		 897 aa  84  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  33.73 
 
 		 937 aa  84  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  33.73 
 
 		 916 aa  83.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  37.4 
 
 		 1028 aa  82  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  36.11 
 
 		 972 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  38.21 
 
 		 1028 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  38.17 
 
 		 428 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  29.19 
 
 		 966 aa  77  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  37.96 
 
 		 145 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  37.96 
 
 		 145 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  36.11 
 
 		 990 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  31.65 
 
 		 992 aa  70.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  34.29 
 
 		 938 aa  69.7  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  37.37 
 
 		 995 aa  65.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0235  hypothetical protein  26.56 
 
 		 713 aa  51.6  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1522  hypothetical protein  30.23 
 
 		 709 aa  50.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.541364  hitchhiker  0.00000000000000176755 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  26.72 
 
 		 557 aa  45.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  28.7 
 
 		 258 aa  45.4  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>