38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4550 on replicon NC_009998
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  100 
 
 		 990 aa  2040    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  61.49 
 
 		 992 aa  1238    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  31.99 
 
 		 937 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  32.25 
 
 		 916 aa  429  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  45.2 
 
 		 428 aa  350  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  25.57 
 
 		 966 aa  267  8e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  25.02 
 
 		 995 aa  213  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  25.56 
 
 		 1028 aa  204  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  26.1 
 
 		 972 aa  160  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  27.35 
 
 		 1011 aa  130  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  26.95 
 
 		 1028 aa  126  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  43.54 
 
 		 853 aa  118  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  39.88 
 
 		 888 aa  111  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  41.52 
 
 		 897 aa  111  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  27.73 
 
 		 938 aa  110  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1243  hypothetical protein  25.41 
 
 		 743 aa  106  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  41.67 
 
 		 894 aa  90.1  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  36.05 
 
 		 895 aa  80.9  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  35.71 
 
 		 909 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  36.72 
 
 		 145 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  36.72 
 
 		 145 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  35.61 
 
 		 906 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 931 aa  75.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  31.91 
 
 		 877 aa  75.5  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  29.63 
 
 		 943 aa  74.7  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  31.08 
 
 		 955 aa  73.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  30.2 
 
 		 889 aa  73.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  30.49 
 
 		 929 aa  71.2  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  37.01 
 
 		 894 aa  68.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  37.01 
 
 		 894 aa  68.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  37.31 
 
 		 883 aa  68.9  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  26.18 
 
 		 633 aa  68.6  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  35.58 
 
 		 892 aa  68.6  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  30.97 
 
 		 896 aa  68.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  26.9 
 
 		 633 aa  67.4  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  34.65 
 
 		 633 aa  67  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  35.43 
 
 		 884 aa  63.9  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  31.71 
 
 		 617 aa  58.9  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>