71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5033 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  100 
 
 		 894 aa  1830    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  25.53 
 
 		 894 aa  185  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  25.53 
 
 		 894 aa  185  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  26.66 
 
 		 896 aa  184  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  24.26 
 
 		 883 aa  181  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  26.36 
 
 		 909 aa  180  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  26.12 
 
 		 892 aa  177  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  26.45 
 
 		 633 aa  171  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  26.67 
 
 		 633 aa  170  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  26.3 
 
 		 633 aa  168  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  25.88 
 
 		 943 aa  158  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  24.37 
 
 		 931 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  24.52 
 
 		 884 aa  156  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  25.37 
 
 		 877 aa  149  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  24.96 
 
 		 617 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  29.53 
 
 		 906 aa  118  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  43.94 
 
 		 853 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  42.45 
 
 		 888 aa  110  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  45.14 
 
 		 428 aa  107  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  41.01 
 
 		 897 aa  103  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  37.97 
 
 		 889 aa  102  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  38.1 
 
 		 895 aa  102  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  41.43 
 
 		 1028 aa  97.4  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  35.66 
 
 		 916 aa  94  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  42.52 
 
 		 995 aa  94  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  35.66 
 
 		 937 aa  94  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  39.29 
 
 		 1028 aa  93.2  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  46.28 
 
 		 1011 aa  93.6  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  37.18 
 
 		 972 aa  92.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  24.97 
 
 		 955 aa  92  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  37.5 
 
 		 966 aa  88.6  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  41.04 
 
 		 992 aa  86.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  39.18 
 
 		 929 aa  85.1  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  37.06 
 
 		 938 aa  84  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  38.52 
 
 		 145 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  38.52 
 
 		 145 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  41.67 
 
 		 990 aa  82  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0095  PHP domain protein  43.96 
 
 		 251 aa  72.4  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000129632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2143  phosphotransferase domain-containing protein  33.7 
 
 		 235 aa  60.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0337  PHP-like protein  41.46 
 
 		 236 aa  55.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268427  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3796  phosphotransferase domain-containing protein  36.59 
 
 		 240 aa  54.3  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0235  hypothetical protein  28.49 
 
 		 713 aa  53.9  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1522  hypothetical protein  30.97 
 
 		 709 aa  53.5  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.541364  hitchhiker  0.00000000000000176755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  39.02 
 
 		 281 aa  50.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0915  PHP domain protein  34.09 
 
 		 249 aa  49.7  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1479  PHP domain protein  33.67 
 
 		 276 aa  49.3  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00132701  normal  0.722152 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  31.45 
 
 		 250 aa  49.3  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0847  phosphotransferase domain-containing protein  39.71 
 
 		 285 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.76564  hitchhiker  0.00314947 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1243  hypothetical protein  23.44 
 
 		 743 aa  48.5  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1232  PHP-like  30.22 
 
 		 306 aa  48.1  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.469628  normal  0.0397506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1975  PHP-like  33.64 
 
 		 293 aa  48.1  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000544393  normal  0.0436962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2552  ABC transporter related  29.13 
 
 		 260 aa  47.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1326  PHP domain protein  35.63 
 
 		 286 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00676626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0336  phosphotransferase domain-containing protein  40.91 
 
 		 286 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149694 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1294  PHP domain protein  31.53 
 
 		 233 aa  45.8  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1448  phosphotransferase domain-containing protein  34.57 
 
 		 288 aa  45.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0662  phosphotransferase domain-containing protein  37.04 
 
 		 294 aa  45.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  32.94 
 
 		 286 aa  45.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1404  hypothetical protein  35.71 
 
 		 215 aa  45.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132129  normal  0.334208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  34.94 
 
 		 279 aa  45.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1492  PHP C-terminal domain protein  34.15 
 
 		 287 aa  45.1  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2402  hypothetical protein  31.71 
 
 		 272 aa  44.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  32.08 
 
 		 322 aa  44.7  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1396  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 252 aa  44.7  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471533  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1610  phosphotransferase domain-containing protein  35.37 
 
 		 287 aa  45.1  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  36.28 
 
 		 268 aa  44.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0914  phosphotransferase domain-containing protein  33.71 
 
 		 232 aa  44.7  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  29.61 
 
 		 241 aa  44.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  29.29 
 
 		 285 aa  44.7  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2114  hypothetical protein  30.49 
 
 		 272 aa  44.7  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0456  phosphotransferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 679 aa  44.7  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.358651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>