274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2402 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2402  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  557  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2114  hypothetical protein  97.79 
 
 
272 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  36.14 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  32.53 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  35.08 
 
 
286 aa  149  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  32.66 
 
 
286 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  33.47 
 
 
286 aa  142  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  32.66 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  33.06 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1736  PHP domain protein  33.06 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0717  PHP domain protein  29.15 
 
 
291 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0221894  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1503  phosphotransferase domain-containing protein  30 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0032645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1914  phosphotransferase domain-containing protein  32.4 
 
 
275 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.629211  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  35.71 
 
 
279 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  31.71 
 
 
275 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1622  phosphotransferase domain-containing protein  31.37 
 
 
278 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0489037  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1744  PHP domain protein  31.23 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3606  PHP domain protein  34.68 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1639  phosphotransferase domain-containing protein  32.28 
 
 
275 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2402  phosphotransferase domain-containing protein  31.6 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1155  hypothetical protein  30.28 
 
 
281 aa  129  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  31.33 
 
 
281 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1248  PHP family metal-dependent phosphoesterase  32.26 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  28 
 
 
285 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1665  PHP domain protein  31.75 
 
 
286 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0193583  hitchhiker  0.000506182 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  27.31 
 
 
270 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0662  phosphotransferase domain-containing protein  31.85 
 
 
267 aa  125  9e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1562  PHP domain protein  28.11 
 
 
287 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2800  phosphotransferase domain-containing protein  31.75 
 
 
302 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660004  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  29.44 
 
 
270 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2721  phosphotransferase domain-containing protein  31.75 
 
 
302 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  29.48 
 
 
279 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3521  phosphotransferase domain-containing protein  30.83 
 
 
301 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1529  phosphotransferase domain-containing protein  30.4 
 
 
286 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70197  normal  0.0178812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2700  phosphotransferase domain-containing protein  31.35 
 
 
302 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3396  phosphotransferase domain-containing protein  29.44 
 
 
283 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000330153  normal  0.345304 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3017  TrpH family protein  30 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1463  phosphotransferase domain-containing protein  30 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1521  phosphotransferase domain-containing protein  30.4 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0120017 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1471  PHP domain protein  29.27 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3099  PHP domain protein  32.26 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000891191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1140  hypothetical protein  26.95 
 
 
286 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  29.3 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2618  phosphotransferase domain-containing protein  30.04 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  30.04 
 
 
280 aa  115  8.999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1078  PHP domain protein  27.86 
 
 
286 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0351695  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2309  PHP domain protein  29.08 
 
 
290 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0982  PHP domain protein  27.86 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.727883  normal  0.091006 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02756  hypothetical protein  29.48 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  27.38 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1553  phosphoesterase PHP-like  29.03 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.653581  normal  0.211268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1141  PHP-like  30.37 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000994847  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1430  phosphotransferase domain-containing protein  29.84 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11310  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  29.2 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0363713  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0511  phosphoesterase PHP, N-terminal  29.21 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.369716  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0844  phosphotransferase domain-containing protein  27.45 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2008  PHP domain protein  29.08 
 
 
296 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.208855  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0883  TrpH protein  29.03 
 
 
269 aa  112  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.33957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7822  PHP domain protein  28.67 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  29.6 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1793  phosphoesterase PHP-like  26.59 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322094  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0442  PHP domain protein  28.74 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000416884 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  29.6 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  29.8 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1492  PHP C-terminal domain protein  27.31 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1479  PHP domain protein  30.08 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00132701  normal  0.722152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  28.89 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1931  PHP domain protein  26.69 
 
 
297 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0107  putative metal-dependent phosphoesterse  26.29 
 
 
297 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  27.97 
 
 
284 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06590  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  28.24 
 
 
295 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366833  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  27.2 
 
 
279 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1092  metal-dependent phosphoesterase  32.56 
 
 
314 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201049  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  26.37 
 
 
280 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1644  phosphotransferase domain-containing protein  29.44 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2911  phosphotransferase domain-containing protein  29.03 
 
 
287 aa  109  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.367074 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19240  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  28.52 
 
 
283 aa  109  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0196602  hitchhiker  0.0091278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3835  PHP domain protein  25.19 
 
 
291 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  29.09 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1610  phosphotransferase domain-containing protein  26.91 
 
 
287 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1064  PHP-like protein  27.21 
 
 
322 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0150  phosphotransferase domain-containing protein  26.46 
 
 
282 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1270  hypothetical protein  31.78 
 
 
280 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3274  phosphotransferase domain-containing protein  27.14 
 
 
287 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156936  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2449  PHP-like protein  27.42 
 
 
286 aa  106  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1465  phosphotransferase domain-containing protein  29.14 
 
 
296 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  29.51 
 
 
264 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0994  PHP domain protein  27.27 
 
 
283 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000016176  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1796  phosphotransferase domain-containing protein  26.36 
 
 
284 aa  106  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.757775  normal  0.756864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1683  PHP domain protein  24.11 
 
 
301 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2128  PHP-like protein  28.4 
 
 
286 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1487  PHP-like  26.38 
 
 
287 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2507  PHP domain protein  25.9 
 
 
282 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1356  phosphotransferase domain-containing protein  26.91 
 
 
287 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15290  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  26.56 
 
 
286 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00297509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7842  phosphotransferase domain-containing protein  26.36 
 
 
284 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0798  hypothetical protein  26 
 
 
290 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0261  phosphotransferase domain-containing protein  29.43 
 
 
270 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3431  phosphotransferase domain-containing protein  27.24 
 
 
292 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2763  PHP domain protein  27.24 
 
 
292 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>