26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0456 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0456  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 
679 aa  1381    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.358651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0235  hypothetical protein  25.57 
 
 
713 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1522  hypothetical protein  23.42 
 
 
709 aa  107  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.541364  hitchhiker  0.00000000000000176755 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2713  PHP domain protein  41.25 
 
 
221 aa  53.9  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  39.76 
 
 
232 aa  53.5  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  22.73 
 
 
493 aa  51.2  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  39.33 
 
 
889 aa  50.8  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  40.96 
 
 
225 aa  50.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1510  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
251 aa  49.3  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2727  PHP domain protein  29.52 
 
 
329 aa  48.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1559  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.53 
 
 
251 aa  47.8  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2401  PHP-like  36.25 
 
 
221 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  23.76 
 
 
877 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1989  phosphate transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 
266 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  40 
 
 
221 aa  45.8  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3292  PHP domain protein  34.18 
 
 
244 aa  45.8  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0354  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 
301 aa  45.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0142036  normal  0.246241 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1790  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 
297 aa  44.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530432  decreased coverage  0.00975681 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1346  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  22.86 
 
 
257 aa  44.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02191  hypothetical protein  22.86 
 
 
257 aa  44.7  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1350  ABC transporter related protein  22.86 
 
 
257 aa  44.7  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02231  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  22.86 
 
 
257 aa  44.7  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.985627  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10951  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  26.13 
 
 
276 aa  44.3  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.79244 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  28.57 
 
 
894 aa  44.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4266  phosphate transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 
257 aa  43.9  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4587  phosphate transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 
257 aa  43.9  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>