208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1404 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1404  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  442  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132129  normal  0.334208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1414  hypothetical protein  86.26 
 
 		 214 aa  382  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00470799  normal  0.0153029 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0385  PHP-like  48.6 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.838582  normal  0.0911256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1597  phosphotransferase domain-containing protein  39.23 
 
 		 221 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667137  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0789  PHP domain protein  44.77 
 
 		 640 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0255666 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2010  PHP-like protein  36.16 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0799075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0400  PHP domain protein  41.95 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3528  PHP domain protein  32.23 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_620  PHP domain protein  38.15 
 
 		 219 aa  121  9e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0713  phosphotransferase domain-containing protein  38.15 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0648  phosphotransferase domain-containing protein  37.57 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  33.94 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1312  PHP domain protein  33.94 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250099  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0352  isoleucyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0789  phosphotransferase domain-containing protein  35.14 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0533  phosphotransferase domain-containing protein  33.51 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0293  phosphotransferase domain-containing protein  35.75 
 
 		 297 aa  108  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.704533  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0655  phosphotransferase domain-containing protein  39.2 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000906576  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1375  phosphotransferase domain-containing protein  32.43 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000413596 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1261  phosphotransferase domain-containing protein  35.84 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1365  phosphotransferase domain-containing protein  35.14 
 
 		 214 aa  105  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222965  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3538  PHP domain protein  35.45 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  32.63 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2401  PHP-like  32.11 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  31.02 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1268  phosphotransferase domain-containing protein  37.5 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0580  PHP domain protein  32.66 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3292  PHP domain protein  30.81 
 
 		 244 aa  99  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2621  phosphotransferase domain-containing protein  30.69 
 
 		 266 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.88374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0612  PHP domain protein  30.18 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.138908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1753  PHP domain protein  33.86 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2713  PHP domain protein  34.78 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3141  phosphotransferase domain-containing protein  32.69 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  31.37 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1258  phosphotransferase domain-containing protein  32.86 
 
 		 299 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.331098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0095  PHP domain protein  36.08 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.411706  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0698  phosphotransferase domain-containing protein  32.86 
 
 		 299 aa  95.1  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2412  PHP-like protein  35.09 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.177718  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0733  PHP domain protein  32.35 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.910762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3529  PHP domain protein  31.74 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1418  phosphotransferase domain-containing protein  33.01 
 
 		 299 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.105026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2338  phosphotransferase domain-containing protein  32.08 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.885404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1232  PHP-like  27.92 
 
 		 306 aa  86.3  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.469628  normal  0.0397506 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3680  PHP domain protein  29.05 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1370  PHP domain protein  29.19 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1860  PHP domain protein  36.75 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1467  PHP domain protein  29.19 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2487  phosphoesterase, PHP-like  29.19 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0668  phosphotransferase domain-containing protein  29.41 
 
 		 304 aa  72  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0474  PHP domain protein  29.59 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.373007  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2007  PHP domain protein  28.17 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1701  phosphotransferase domain-containing protein  34.91 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  0.300647 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2823  PHP domain protein  36.79 
 
 		 352 aa  65.1  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2521  PHP domain protein  26.77 
 
 		 331 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.428127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1381  phosphotransferase domain-containing protein  26.6 
 
 		 259 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2482  hypothetical protein  30.46 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  34.26 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1471  PHP domain protein  43.37 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  41.98 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1306  phosphotransferase domain-containing protein  22.86 
 
 		 514 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.92979  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  25.96 
 
 		 1165 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20030  PHP domain protein  26.7 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  41.56 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0776  PHP domain protein  27.52 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1137  hypothetical protein  25.81 
 
 		 254 aa  52.4  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.322631  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2121  PHP domain protein  24.18 
 
 		 308 aa  52.4  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1553  phosphoesterase PHP-like  37.5 
 
 		 297 aa  52  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.653581  normal  0.211268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2902  PHP domain protein  24.88 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  35.09 
 
 		 264 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  35.64 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0844  phosphoesterase PHP-like  27.78 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.39304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0909  PHP domain protein  29.68 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  43.75 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0681  phosphotransferase domain-containing protein  37.88 
 
 		 284 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255155  normal  0.888291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  37.88 
 
 		 284 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 458 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_002936  DET1610  phosphotransferase domain-containing protein  45.07 
 
 		 287 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  29.73 
 
 		 460 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1503  phosphotransferase domain-containing protein  40.91 
 
 		 294 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0032645  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  40 
 
 		 280 aa  49.3  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1492  PHP C-terminal domain protein  43.66 
 
 		 287 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  35.56 
 
 		 275 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0961  PHP-like  26.92 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1931  PHP domain protein  40.3 
 
 		 297 aa  48.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1975  PHP-like  50 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000544393  normal  0.0436962 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3436  phosphotransferase domain-containing protein  33.67 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2402  hypothetical protein  37.88 
 
 		 272 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0442  PHP domain protein  33.33 
 
 		 321 aa  47.8  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000416884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0571  PHP domain protein  38.1 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1172  PHP domain protein  29.73 
 
 		 353 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0555616 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  34.31 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  37.8 
 
 		 282 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2311  PHP domain protein  50 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000176637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  36.67 
 
 		 816 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1912  PHP domain protein  49.02 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.657116 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2114  hypothetical protein  39.39 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0717  PHP domain protein  35.8 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0221894  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2808  phosphotransferase domain-containing protein  46.81 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000695757  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  25.27 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  34.38 
 
 		 286 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>