46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1540 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  46.56 
 
 		 931 aa  790    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  44.97 
 
 		 929 aa  759    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  51.85 
 
 		 955 aa  934    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 943 aa  1924    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  25.94 
 
 		 895 aa  237  6e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  25.66 
 
 		 909 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  26.08 
 
 		 892 aa  172  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  25.35 
 
 		 894 aa  169  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  25.35 
 
 		 896 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  23.36 
 
 		 884 aa  140  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  26.23 
 
 		 877 aa  135  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  49.17 
 
 		 906 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  40.94 
 
 		 633 aa  101  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  40.94 
 
 		 633 aa  101  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  40.94 
 
 		 633 aa  100  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  40.98 
 
 		 853 aa  100  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  41.22 
 
 		 428 aa  99.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  41.54 
 
 		 888 aa  98.6  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  39.86 
 
 		 894 aa  94.4  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  39.86 
 
 		 894 aa  94.4  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  44.54 
 
 		 1028 aa  94  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  42.86 
 
 		 897 aa  94  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  38.4 
 
 		 883 aa  93.2  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  42.86 
 
 		 1028 aa  89.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  24.22 
 
 		 937 aa  89  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  24.1 
 
 		 916 aa  87.4  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  39.34 
 
 		 617 aa  85.5  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  32.28 
 
 		 966 aa  85.1  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  32.41 
 
 		 992 aa  80.9  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  33.1 
 
 		 1011 aa  76.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  28.09 
 
 		 938 aa  75.9  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  32.39 
 
 		 972 aa  75.1  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  26.11 
 
 		 889 aa  74.3  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  29.63 
 
 		 990 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  30.32 
 
 		 995 aa  73.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1646  AAA-4 family protein  27.05 
 
 		 770 aa  65.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1641  AAA-4 family protein  26.56 
 
 		 773 aa  64.3  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.49775  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1312  AAA-4 family protein  25.73 
 
 		 774 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201459  normal  0.370509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4332  AAA-4 family protein  25.69 
 
 		 777 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1391  putative transcriptional regulator  25.27 
 
 		 586 aa  60.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  32.69 
 
 		 145 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  32.69 
 
 		 145 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  25.71 
 
 		 1153 aa  49.7  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0235  hypothetical protein  23.43 
 
 		 713 aa  46.2  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  26.85 
 
 		 1174 aa  45.8  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  26.45 
 
 		 523 aa  44.7  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>