50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3230 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  100 
 
 
896 aa  1820    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  52.67 
 
 
892 aa  915    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  51.13 
 
 
894 aa  877    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  51.13 
 
 
894 aa  877    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  36.62 
 
 
884 aa  534  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  33.89 
 
 
883 aa  506  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  28.48 
 
 
909 aa  283  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  29.13 
 
 
906 aa  266  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  27.05 
 
 
894 aa  192  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  28.4 
 
 
633 aa  184  9.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  25.48 
 
 
877 aa  181  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  26.79 
 
 
955 aa  178  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  27.52 
 
 
633 aa  174  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  28.16 
 
 
633 aa  172  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  27.22 
 
 
931 aa  170  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  27.69 
 
 
929 aa  167  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  25.63 
 
 
943 aa  157  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  24.42 
 
 
889 aa  142  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  23.78 
 
 
888 aa  122  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  23.01 
 
 
966 aa  112  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  23.37 
 
 
853 aa  111  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  44.8 
 
 
895 aa  103  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  39.38 
 
 
617 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  37.84 
 
 
972 aa  95.9  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  41.38 
 
 
897 aa  94.4  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  40 
 
 
937 aa  82.8  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  40 
 
 
916 aa  82.4  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  37.21 
 
 
428 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  36.72 
 
 
1028 aa  77.8  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  38.46 
 
 
1011 aa  76.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  36.43 
 
 
1028 aa  76.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  35.46 
 
 
145 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  35.46 
 
 
145 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  32.03 
 
 
938 aa  69.3  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  35.58 
 
 
990 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  39.22 
 
 
995 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  37.86 
 
 
992 aa  65.5  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0095  PHP domain protein  39.74 
 
 
251 aa  58.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1312  AAA-4 family protein  23.18 
 
 
774 aa  58.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201459  normal  0.370509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4332  AAA-4 family protein  29.63 
 
 
777 aa  57.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1641  AAA-4 family protein  23.66 
 
 
773 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.49775  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1391  putative transcriptional regulator  24.16 
 
 
586 aa  56.2  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1646  AAA-4 family protein  26.23 
 
 
770 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0337  PHP-like protein  31.2 
 
 
236 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1522  hypothetical protein  28.89 
 
 
709 aa  49.3  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.541364  hitchhiker  0.00000000000000176755 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1243  hypothetical protein  32.32 
 
 
743 aa  48.5  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3796  phosphotransferase domain-containing protein  42.86 
 
 
240 aa  48.5  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0235  hypothetical protein  29.69 
 
 
713 aa  45.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2143  phosphotransferase domain-containing protein  38.3 
 
 
235 aa  44.3  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0914  phosphotransferase domain-containing protein  23.48 
 
 
232 aa  44.7  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>