36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1286 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  97.79 
 
 		 633 aa  1263    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  97.47 
 
 		 633 aa  1263    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  100 
 
 		 633 aa  1293    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  31.99 
 
 		 617 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  30.2 
 
 		 883 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  30.42 
 
 		 884 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  27.99 
 
 		 894 aa  200  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  27.99 
 
 		 894 aa  200  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  27.84 
 
 		 909 aa  190  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  27.42 
 
 		 892 aa  188  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  28.4 
 
 		 896 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  26.67 
 
 		 894 aa  170  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  27.36 
 
 		 906 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  24.96 
 
 		 895 aa  133  9e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  25.18 
 
 		 955 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  27.3 
 
 		 931 aa  112  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  24.38 
 
 		 889 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  41.91 
 
 		 929 aa  94.4  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  40.94 
 
 		 943 aa  91.7  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  42.24 
 
 		 877 aa  89.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  40.46 
 
 		 888 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  37.98 
 
 		 853 aa  81.6  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  37.32 
 
 		 972 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  40.5 
 
 		 1028 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  38.33 
 
 		 1028 aa  77.8  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  38.35 
 
 		 897 aa  77  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  36.42 
 
 		 966 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  38.58 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  38.66 
 
 		 1011 aa  73.9  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  40.4 
 
 		 995 aa  73.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  36.79 
 
 		 992 aa  66.6  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  31.72 
 
 		 938 aa  63.9  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  36.27 
 
 		 990 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  31.76 
 
 		 641 aa  44.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>