49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1493 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  100 
 
 		 892 aa  1809    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  52.67 
 
 		 896 aa  916    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  58.69 
 
 		 894 aa  1058    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  58.69 
 
 		 894 aa  1058    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  36.4 
 
 		 884 aa  519  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  33.96 
 
 		 883 aa  498  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  30.26 
 
 		 909 aa  299  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  29.16 
 
 		 906 aa  262  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  27.49 
 
 		 633 aa  198  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  27.95 
 
 		 633 aa  198  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  27.42 
 
 		 633 aa  197  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  26.41 
 
 		 894 aa  184  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  25.24 
 
 		 877 aa  179  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  28.37 
 
 		 617 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  24.13 
 
 		 889 aa  173  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  25.97 
 
 		 943 aa  167  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  25.74 
 
 		 955 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  23.88 
 
 		 853 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  44.72 
 
 		 895 aa  100  8e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  37.84 
 
 		 972 aa  94  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 931 aa  92.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  43.94 
 
 		 897 aa  90.9  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  29.05 
 
 		 929 aa  90.9  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  40.65 
 
 		 888 aa  89.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  24.44 
 
 		 995 aa  87.4  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  40.3 
 
 		 1028 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  32.72 
 
 		 1011 aa  84.7  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  39.26 
 
 		 916 aa  84  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  39.26 
 
 		 937 aa  84  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  38.81 
 
 		 1028 aa  82  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  38.76 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  35.46 
 
 		 966 aa  80.9  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  39.47 
 
 		 145 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  39.47 
 
 		 145 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  37.86 
 
 		 992 aa  69.7  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  35.58 
 
 		 990 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  31.12 
 
 		 938 aa  67  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1391  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 586 aa  47.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  26.76 
 
 		 552 aa  47  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0095  PHP domain protein  42.86 
 
 		 251 aa  47.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000129632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4332  AAA-4 family protein  25.7 
 
 		 777 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0694  PHP domain protein  41.67 
 
 		 259 aa  47.8  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1522  hypothetical protein  30 
 
 		 709 aa  46.6  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.541364  hitchhiker  0.00000000000000176755 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  25.53 
 
 		 556 aa  46.6  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  24.74 
 
 		 555 aa  45.8  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  31.4 
 
 		 1115 aa  45.8  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2143  phosphotransferase domain-containing protein  37.5 
 
 		 235 aa  45.4  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1243  hypothetical protein  36.26 
 
 		 743 aa  44.7  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1866  SMC domain-containing protein  26.5 
 
 		 531 aa  44.3  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>