43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2629 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  66.81 
 
 
931 aa  1220    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 
929 aa  1895    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  47.69 
 
 
955 aa  830    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  44.97 
 
 
943 aa  769    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  23.61 
 
 
895 aa  218  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  27.4 
 
 
909 aa  184  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  27.69 
 
 
896 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  24.77 
 
 
892 aa  151  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  43.57 
 
 
906 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  24.58 
 
 
877 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  42.65 
 
 
633 aa  104  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  43.57 
 
 
633 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  41.91 
 
 
633 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  35.29 
 
 
883 aa  95.5  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  38.1 
 
 
884 aa  94.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  38.02 
 
 
894 aa  93.2  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  36.22 
 
 
853 aa  93.6  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  41.86 
 
 
428 aa  92.8  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  34.81 
 
 
966 aa  92  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  35.98 
 
 
916 aa  90.5  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  35.98 
 
 
937 aa  90.9  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  38.17 
 
 
888 aa  87.8  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  42.86 
 
 
1028 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  38.93 
 
 
894 aa  86.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  38.93 
 
 
894 aa  86.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  28.12 
 
 
1028 aa  86.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  40.31 
 
 
897 aa  85.5  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  34.07 
 
 
617 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  36.55 
 
 
992 aa  81.3  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  30.57 
 
 
972 aa  80.1  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  33.96 
 
 
1011 aa  78.2  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  36.27 
 
 
995 aa  78.2  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  31.03 
 
 
938 aa  72.8  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  34.95 
 
 
990 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  37.96 
 
 
145 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  37.96 
 
 
145 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4332  AAA-4 family protein  26.1 
 
 
777 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1646  AAA-4 family protein  27.72 
 
 
770 aa  61.2  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1391  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 
586 aa  61.2  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1641  AAA-4 family protein  23.38 
 
 
773 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.49775  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1312  AAA-4 family protein  23.96 
 
 
774 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201459  normal  0.370509 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  22.49 
 
 
889 aa  56.2  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0095  PHP domain protein  22.05 
 
 
251 aa  47  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>