44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3193 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  58.69 
 
 		 892 aa  1058    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  51.13 
 
 		 896 aa  879    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  100 
 
 		 894 aa  1826    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  100 
 
 		 894 aa  1826    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  35.09 
 
 		 884 aa  480  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  31.78 
 
 		 883 aa  448  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  29.81 
 
 		 909 aa  293  8e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  28.91 
 
 		 906 aa  251  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  27.99 
 
 		 633 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  28.17 
 
 		 633 aa  210  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  28.17 
 
 		 633 aa  209  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  25.81 
 
 		 894 aa  191  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  25.95 
 
 		 889 aa  190  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  26.99 
 
 		 877 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  26.06 
 
 		 955 aa  144  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  28.62 
 
 		 617 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  46.28 
 
 		 895 aa  107  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  23.45 
 
 		 966 aa  106  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  40.56 
 
 		 972 aa  98.2  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  41.33 
 
 		 897 aa  97.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  41.86 
 
 		 888 aa  89.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  39.69 
 
 		 853 aa  90.1  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  39.86 
 
 		 943 aa  90.1  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  30.48 
 
 		 931 aa  89  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  38.93 
 
 		 929 aa  84.3  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  33.33 
 
 		 1011 aa  79  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  35.43 
 
 		 1028 aa  77.8  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  35.88 
 
 		 1028 aa  76.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  36.76 
 
 		 937 aa  76.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  36.76 
 
 		 916 aa  76.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  37.01 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  33.9 
 
 		 145 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  33.9 
 
 		 145 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  37.01 
 
 		 990 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  24.55 
 
 		 938 aa  67  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  33.64 
 
 		 995 aa  62  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  33.66 
 
 		 992 aa  60.1  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1646  AAA-4 family protein  25.47 
 
 		 770 aa  52.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1312  AAA-4 family protein  25.93 
 
 		 774 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201459  normal  0.370509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1641  AAA-4 family protein  25.1 
 
 		 773 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.49775  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0235  hypothetical protein  30.77 
 
 		 713 aa  48.9  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  29.88 
 
 		 552 aa  47.8  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4332  AAA-4 family protein  26.21 
 
 		 777 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  25.11 
 
 		 858 aa  45.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>