36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2715 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  97.79 
 
 		 633 aa  1263    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  98.42 
 
 		 633 aa  1274    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  100 
 
 		 633 aa  1291    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  32.92 
 
 		 617 aa  290  8e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  30.05 
 
 		 883 aa  223  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  30.42 
 
 		 884 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  28.17 
 
 		 894 aa  200  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  28.17 
 
 		 894 aa  200  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  27.49 
 
 		 892 aa  189  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  27.87 
 
 		 909 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  26.3 
 
 		 894 aa  168  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  27.52 
 
 		 896 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  27.82 
 
 		 906 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  25.11 
 
 		 877 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  27.86 
 
 		 931 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  23.66 
 
 		 889 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  25.51 
 
 		 955 aa  108  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  39.86 
 
 		 895 aa  108  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  43.57 
 
 		 929 aa  95.9  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  40.94 
 
 		 943 aa  90.9  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  40.6 
 
 		 888 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  27.74 
 
 		 853 aa  83.2  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  37.32 
 
 		 972 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  26.89 
 
 		 966 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  38.81 
 
 		 897 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  39.67 
 
 		 1028 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  37.5 
 
 		 1028 aa  76.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  38.58 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  38.66 
 
 		 1011 aa  73.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  40.82 
 
 		 995 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  37.27 
 
 		 145 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  37.27 
 
 		 145 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  35.85 
 
 		 992 aa  65.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  32.41 
 
 		 938 aa  65.1  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  36.27 
 
 		 990 aa  63.9  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  30.23 
 
 		 370 aa  43.5  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>