41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0667 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  44.88 
 
 		 897 aa  794    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  100 
 
 		 888 aa  1830    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  39.35 
 
 		 853 aa  437  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1243  hypothetical protein  30.46 
 
 		 743 aa  137  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  26.2 
 
 		 938 aa  133  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  26.36 
 
 		 995 aa  125  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  35.68 
 
 		 937 aa  122  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  35.68 
 
 		 916 aa  122  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  28.46 
 
 		 972 aa  122  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  45.33 
 
 		 428 aa  119  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  28.46 
 
 		 966 aa  118  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  23.78 
 
 		 896 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  42.45 
 
 		 894 aa  110  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  42 
 
 		 992 aa  107  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  39.88 
 
 		 990 aa  104  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  42.54 
 
 		 1028 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  26.42 
 
 		 1028 aa  98.6  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  36.43 
 
 		 1011 aa  94.7  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  39.42 
 
 		 889 aa  92.4  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  40.91 
 
 		 895 aa  92.4  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  41.54 
 
 		 943 aa  91.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  38.81 
 
 		 877 aa  90.5  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  44.12 
 
 		 955 aa  86.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  40.65 
 
 		 892 aa  85.9  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  37.98 
 
 		 906 aa  86.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  40.46 
 
 		 633 aa  85.5  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  40.6 
 
 		 633 aa  85.5  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  40.6 
 
 		 633 aa  85.1  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  41.86 
 
 		 894 aa  85.1  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  41.86 
 
 		 894 aa  85.1  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  37.5 
 
 		 909 aa  84.3  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  40 
 
 		 929 aa  82.8  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  40.78 
 
 		 931 aa  82  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  37.88 
 
 		 883 aa  80.5  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  39.69 
 
 		 884 aa  78.2  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  35.78 
 
 		 145 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  36.72 
 
 		 617 aa  76.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  35.78 
 
 		 145 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1522  hypothetical protein  30.56 
 
 		 709 aa  45.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.541364  hitchhiker  0.00000000000000176755 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5585  hypothetical protein  26.57 
 
 		 258 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0168828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 254 aa  45.8  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>