43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1607 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 909 aa  1828    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  68.14 
 
 		 906 aa  1223    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  30.26 
 
 		 892 aa  290  7e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  29.81 
 
 		 894 aa  283  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  29.81 
 
 		 894 aa  283  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  27.9 
 
 		 889 aa  280  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  28.4 
 
 		 877 aa  278  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  28.48 
 
 		 896 aa  274  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  27.81 
 
 		 884 aa  242  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  26.3 
 
 		 883 aa  227  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  27.84 
 
 		 633 aa  190  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  27.71 
 
 		 633 aa  188  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  27.87 
 
 		 633 aa  189  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  26.36 
 
 		 894 aa  180  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  27.37 
 
 		 931 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  28.16 
 
 		 617 aa  175  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  27.2 
 
 		 929 aa  168  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  21.57 
 
 		 895 aa  159  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  25.46 
 
 		 943 aa  159  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  35.71 
 
 		 853 aa  90.5  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  30.65 
 
 		 937 aa  89.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  30.65 
 
 		 916 aa  90.1  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  40.26 
 
 		 955 aa  88.6  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  37.7 
 
 		 1011 aa  84.3  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  37.5 
 
 		 888 aa  84.3  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  38.76 
 
 		 897 aa  82.8  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  35.86 
 
 		 972 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  35.77 
 
 		 1028 aa  78.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  35.88 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  36.59 
 
 		 1028 aa  77.4  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  27.95 
 
 		 966 aa  74.3  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  35.71 
 
 		 990 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  40.21 
 
 		 995 aa  70.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  34.29 
 
 		 938 aa  69.3  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  32.39 
 
 		 992 aa  68.6  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0235  hypothetical protein  27.34 
 
 		 713 aa  50.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  28.7 
 
 		 258 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1646  AAA-4 family protein  25.39 
 
 		 770 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1522  hypothetical protein  28.68 
 
 		 709 aa  47  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.541364  hitchhiker  0.00000000000000176755 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1641  AAA-4 family protein  23.68 
 
 		 773 aa  45.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.49775  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1312  AAA-4 family protein  22.92 
 
 		 774 aa  44.3  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201459  normal  0.370509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>