48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1391 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1391  putative transcriptional regulator  100 
 
 
586 aa  1215    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1646  AAA-4 family protein  39.65 
 
 
770 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1312  AAA-4 family protein  39.07 
 
 
774 aa  382  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201459  normal  0.370509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1641  AAA-4 family protein  38.7 
 
 
773 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.49775  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4332  AAA-4 family protein  37.35 
 
 
777 aa  360  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  23.99 
 
 
895 aa  64.7  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  24.15 
 
 
931 aa  62.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  26.05 
 
 
955 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  24.59 
 
 
929 aa  61.6  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  34.82 
 
 
494 aa  60.8  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  25.27 
 
 
943 aa  60.5  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  23.45 
 
 
883 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  29.84 
 
 
396 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 
374 aa  58.9  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  29.69 
 
 
377 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  29.69 
 
 
377 aa  58.9  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  26.39 
 
 
218 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  24.16 
 
 
896 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 
484 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  30.36 
 
 
469 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  25.4 
 
 
433 aa  55.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  31.86 
 
 
207 aa  53.9  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  28.96 
 
 
412 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  32.65 
 
 
382 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  28.91 
 
 
389 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 
485 aa  50.8  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 
386 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  27.21 
 
 
471 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  28.32 
 
 
402 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  26.87 
 
 
208 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0095  PHP domain protein  28.8 
 
 
251 aa  48.9  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129632 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  28.28 
 
 
467 aa  48.5  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  31.65 
 
 
462 aa  48.1  0.0005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 
586 aa  47.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  32.38 
 
 
892 aa  47.8  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0527  hypothetical protein  23.36 
 
 
429 aa  47  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  24.81 
 
 
479 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0694  PHP domain protein  22.1 
 
 
259 aa  47  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 
209 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  25.96 
 
 
391 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0557  putative transcriptional regulator  21.68 
 
 
360 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0830  putative transcriptional regulator  23.76 
 
 
478 aa  45.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.702449 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  46 
 
 
1075 aa  44.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  42.31 
 
 
1181 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  24.11 
 
 
477 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  31.76 
 
 
412 aa  43.9  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 
241 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2864  transcriptional regulator  28.21 
 
 
319 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>