More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1492 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1492  PHP C-terminal domain protein  100 
 
 
287 aa  588  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1610  phosphotransferase domain-containing protein  94.77 
 
 
287 aa  565  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1356  phosphotransferase domain-containing protein  93.38 
 
 
287 aa  556  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  47.43 
 
 
275 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  45.08 
 
 
270 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1622  phosphotransferase domain-containing protein  40.07 
 
 
278 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0489037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  44.35 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1914  phosphotransferase domain-containing protein  42.07 
 
 
275 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.629211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1248  PHP family metal-dependent phosphoesterase  41.83 
 
 
284 aa  210  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1562  PHP domain protein  41.89 
 
 
287 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  42.26 
 
 
270 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  39.13 
 
 
286 aa  204  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  38.41 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  38.41 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  37.01 
 
 
280 aa  196  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  37.59 
 
 
286 aa  194  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1471  PHP domain protein  43.15 
 
 
273 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  38.04 
 
 
286 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  38.15 
 
 
286 aa  193  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1736  PHP domain protein  39.49 
 
 
286 aa  190  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  39.76 
 
 
282 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3099  PHP domain protein  38.78 
 
 
286 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000891191  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1639  phosphotransferase domain-containing protein  37.3 
 
 
275 aa  189  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1479  PHP domain protein  40.24 
 
 
276 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00132701  normal  0.722152 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0662  phosphotransferase domain-containing protein  35.94 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1503  phosphotransferase domain-containing protein  36.33 
 
 
294 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0032645  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  38.43 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7822  PHP domain protein  38.93 
 
 
288 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3835  PHP domain protein  36.59 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0511  phosphoesterase PHP, N-terminal  39.1 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.369716  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  38.03 
 
 
280 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  35.87 
 
 
279 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1796  phosphotransferase domain-containing protein  38.63 
 
 
284 aa  176  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.757775  normal  0.756864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  38.13 
 
 
280 aa  175  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1266  PHP domain protein  35.51 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1367  PHP domain protein  35.51 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  37.1 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2582  phosphoesterase, PHP-like  34.8 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  36.08 
 
 
285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1278  phosphotransferase domain-containing protein  34.94 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3606  PHP domain protein  34.8 
 
 
279 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  38.71 
 
 
288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2808  phosphotransferase domain-containing protein  35.11 
 
 
288 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000695757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3436  phosphotransferase domain-containing protein  36.2 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0717  PHP domain protein  35.89 
 
 
291 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0221894  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  36.88 
 
 
284 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1536  PHP domain protein  38.71 
 
 
274 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1744  PHP domain protein  37.45 
 
 
286 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1270  hypothetical protein  34.53 
 
 
280 aa  158  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3094  phosphoesterase PHP-like  38.31 
 
 
289 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2828  PHP-like  34.38 
 
 
288 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1092  metal-dependent phosphoesterase  34.43 
 
 
314 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1975  PHP-like  34.92 
 
 
293 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000544393  normal  0.0436962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1326  PHP domain protein  33.7 
 
 
286 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00676626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2957  PHP domain protein  38.27 
 
 
280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1397  hypothetical protein  32.39 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1553  phosphoesterase PHP-like  36.95 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.653581  normal  0.211268 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  32.79 
 
 
279 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15290  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  36.5 
 
 
286 aa  149  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00297509  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11310  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  36.9 
 
 
294 aa  149  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0363713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1912  PHP domain protein  33.79 
 
 
293 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.657116 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2618  phosphotransferase domain-containing protein  34.94 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2311  PHP domain protein  34.62 
 
 
285 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000176637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  37.3 
 
 
285 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1140  hypothetical protein  33.6 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3521  phosphotransferase domain-containing protein  33.99 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  35.32 
 
 
279 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0704  PHP domain protein  36.51 
 
 
280 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1448  phosphotransferase domain-containing protein  33.92 
 
 
288 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3826  PHP-like  38.58 
 
 
289 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.596413  normal  0.059434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2507  PHP domain protein  35.32 
 
 
282 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0909  metal-dependent phosphoesterase  35.77 
 
 
291 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.531457  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02756  hypothetical protein  33.6 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1465  phosphotransferase domain-containing protein  32.94 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27790  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  35.6 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0386409  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4259  PHP domain protein  34.72 
 
 
294 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2480  PHP domain protein  33.58 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0141576 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1878  phosphotransferase domain-containing protein  31.17 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1064  PHP-like protein  32.94 
 
 
322 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1941  PHP domain protein  30.5 
 
 
289 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02287  PHP domain protein  34.24 
 
 
297 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.624872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0662  phosphotransferase domain-containing protein  32.18 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0712  PHP domain protein  29.54 
 
 
290 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1141  PHP-like  36.25 
 
 
291 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000994847  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1078  PHP domain protein  33.73 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0351695  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0442  PHP domain protein  34.78 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000416884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0982  PHP domain protein  33.33 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.727883  normal  0.091006 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  34.01 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0890  hypothetical protein  32.93 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347424  normal  0.445222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0687  phosphotransferase domain-containing protein  35.14 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134262  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0798  hypothetical protein  32.4 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5249  PHP domain protein  30.63 
 
 
272 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.815864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1687  phosphotransferase domain-containing protein  32.68 
 
 
285 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5748  PHP domain protein  33.46 
 
 
299 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1877  PHP-like protein  33.33 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0681  phosphotransferase domain-containing protein  33.33 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255155  normal  0.888291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15640  Phosphoesterase (PHP family)  31.54 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0107  putative metal-dependent phosphoesterse  32.27 
 
 
297 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1919  phosphotransferase domain-containing protein  32.57 
 
 
335 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06590  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  32.38 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>