286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2828 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2828  PHP-like  100 
 
 		 288 aa  594  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02287  PHP domain protein  65.09 
 
 		 297 aa  367  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.624872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3521  phosphotransferase domain-containing protein  49.28 
 
 		 301 aa  295  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0798  hypothetical protein  47.33 
 
 		 290 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1061  phosphotransferase domain-containing protein  48.58 
 
 		 291 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1155  hypothetical protein  46.93 
 
 		 281 aa  276  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02756  hypothetical protein  43.51 
 
 		 292 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2666  phosphotransferase domain-containing protein  46.52 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000470189 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2700  phosphotransferase domain-containing protein  46.74 
 
 		 302 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2721  phosphotransferase domain-containing protein  46.74 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2800  phosphotransferase domain-containing protein  46.38 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2449  PHP-like protein  46.01 
 
 		 286 aa  259  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1665  PHP domain protein  46.74 
 
 		 286 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0193583  hitchhiker  0.000506182 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2309  PHP domain protein  45.56 
 
 		 290 aa  258  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2402  phosphotransferase domain-containing protein  46.38 
 
 		 286 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2911  phosphotransferase domain-containing protein  45.35 
 
 		 287 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.367074 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2008  PHP domain protein  46.04 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.208855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2203  phosphotransferase domain-containing protein  44.29 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209881 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1490  putative phosphoesterase  44.73 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1687  phosphotransferase domain-containing protein  45.35 
 
 		 285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1898  putative phosphoesterase  44.85 
 
 		 293 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000460558 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1375  putative phosphoesterase  44.73 
 
 		 286 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1465  putative phosphoesterase  44.73 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.200678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01240  hypothetical protein  44.85 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2383  PHP domain protein  44.85 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00108738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01250  hypothetical protein  44.85 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2362  phosphotransferase domain-containing protein  44.85 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1430  phosphotransferase domain-containing protein  46.47 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1867  putative phosphoesterase  44.85 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000652478 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0883  TrpH protein  48.13 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.33957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1607  putative phosphoesterase  44.73 
 
 		 282 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728178 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1853  putative phosphoesterase  44.73 
 
 		 282 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1425  putative phosphoesterase  44.73 
 
 		 282 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.769482  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1911  putative phosphoesterase  44.73 
 
 		 282 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000200072 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2128  PHP-like protein  45.19 
 
 		 286 aa  247  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1848  putative phosphoesterase  44.73 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  hitchhiker  0.000620806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1930  phosphotransferase domain-containing protein  46.69 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2041  phosphotransferase domain-containing protein  46.69 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.67494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2311  phosphotransferase domain-containing protein  45.36 
 
 		 310 aa  245  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1644  phosphotransferase domain-containing protein  43.17 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1931  PHP domain protein  42.65 
 
 		 297 aa  241  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2250  phosphotransferase domain-containing protein  44.65 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1463  phosphotransferase domain-containing protein  46.01 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1521  phosphotransferase domain-containing protein  45.29 
 
 		 286 aa  239  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120017 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1529  phosphotransferase domain-containing protein  45.65 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70197  normal  0.0178812 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3017  TrpH family protein  45.29 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2171  PHP domain protein  44.24 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003090  PHP family hydrolase  41.67 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  40.21 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1718  hypothetical protein  42.7 
 
 		 278 aa  222  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1397  hypothetical protein  39.86 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1878  phosphotransferase domain-containing protein  43.75 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  39.56 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  39.71 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1140  hypothetical protein  38.99 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22820  PHP domain-containing protein  41.52 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.141448 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0150  phosphotransferase domain-containing protein  39.85 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3586  phosphoesterase PHP, N-terminal:PHP, C-terminal  40.43 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1810  PHP domain protein  40.07 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1487  PHP-like  39.71 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0359  phosphotransferase domain-containing protein  39.56 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663247  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  38.6 
 
 		 286 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  38.6 
 
 		 286 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0982  PHP domain protein  39.78 
 
 		 286 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.727883  normal  0.091006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1926  hypothetical protein  40.43 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1528  phosphoesterase PHP  38.77 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1834  phosphotransferase domain-containing protein  40.43 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.423951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1078  PHP domain protein  39.42 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0351695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0844  phosphotransferase domain-containing protein  38.69 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15640  Phosphoesterase (PHP family)  40.91 
 
 		 287 aa  188  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3789  phosphotransferase domain-containing protein  38.08 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806386 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3274  phosphotransferase domain-containing protein  38.99 
 
 		 287 aa  188  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0687  phosphotransferase domain-containing protein  40.29 
 
 		 284 aa  188  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4500  trpH family protein  38.43 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1412  phosphotransferase domain-containing protein  38.43 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0394495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4006  phosphotransferase domain-containing protein  38.43 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000044787 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3396  phosphotransferase domain-containing protein  36.59 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000330153  normal  0.345304 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1877  PHP-like protein  36.79 
 
 		 284 aa  185  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2763  PHP domain protein  36.5 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3431  phosphotransferase domain-containing protein  36.5 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0994  PHP domain protein  37.87 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000016176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4021  PHP domain protein  39.05 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2756  hypothetical protein  38.85 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.308411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1432  phosphotransferase domain-containing protein  35.02 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1064  PHP-like protein  36.46 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1580  hypothetical protein  33.21 
 
 		 276 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2570  putative phosphoesterase  35.38 
 
 		 276 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1683  phosphoesterase, putative  35.38 
 
 		 276 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.478385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2624  putative phosphoesterase  35.38 
 
 		 276 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2703  metal-dependent phosphoesterase  35.38 
 
 		 276 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1458  putative phosphoesterase  35.38 
 
 		 276 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.525021  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3132  putative phosphoesterase  35.38 
 
 		 276 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322538  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3707  phosphotransferase domain-containing protein  36.13 
 
 		 287 aa  178  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2185  putative phosphoesterase  35.38 
 
 		 276 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2462  PHP, C-terminal  38.83 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.735424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2553  PHP domain protein  32.85 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000196897  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1005  PHP-like  37.59 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117289 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1973  PHP-like  37.2 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5411  phosphotransferase domain-containing protein  37.59 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1174  phosphotransferase domain-containing protein  35.02 
 
 		 279 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806701  decreased coverage  0.000000145397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>