More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0442 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0442  PHP domain protein  100 
 
 
321 aa  674    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000416884 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0107  putative metal-dependent phosphoesterse  62.41 
 
 
297 aa  355  7.999999999999999e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27790  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  49.44 
 
 
284 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0386409  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0704  PHP domain protein  46.55 
 
 
280 aa  235  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11310  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  45.85 
 
 
294 aa  233  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0363713  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0771  PHP domain protein  46.1 
 
 
279 aa  229  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2480  PHP domain protein  44.73 
 
 
280 aa  225  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0141576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2507  PHP domain protein  43.75 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2909  PHP domain protein  45.26 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308532  normal  0.0259754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  43.91 
 
 
285 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19240  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  41.96 
 
 
283 aa  211  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0196602  hitchhiker  0.0091278 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15290  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  42.65 
 
 
286 aa  206  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00297509  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2787  phosphotransferase domain-containing protein  41.54 
 
 
282 aa  188  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  41.07 
 
 
284 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3099  PHP domain protein  37.87 
 
 
286 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000891191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  39.05 
 
 
270 aa  172  9e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7822  PHP domain protein  38.46 
 
 
288 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2164  PHP domain protein  40 
 
 
287 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  hitchhiker  0.000429759 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  36.92 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0681  phosphotransferase domain-containing protein  40.71 
 
 
284 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255155  normal  0.888291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  38.32 
 
 
280 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4259  PHP domain protein  39.63 
 
 
294 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1796  phosphotransferase domain-containing protein  39.21 
 
 
284 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.757775  normal  0.756864 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1471  PHP domain protein  35.07 
 
 
273 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06590  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  37.86 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366833  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0820  PHP domain protein  39.29 
 
 
285 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000400643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  35.04 
 
 
282 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  32.32 
 
 
286 aa  149  8e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3826  PHP-like  38.04 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.596413  normal  0.059434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  34.77 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1914  phosphotransferase domain-containing protein  34.8 
 
 
275 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.629211  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1465  phosphotransferase domain-containing protein  38.57 
 
 
296 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0662  phosphotransferase domain-containing protein  34.12 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1639  phosphotransferase domain-containing protein  34.5 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  31.29 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7842  phosphotransferase domain-containing protein  35.74 
 
 
284 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1248  PHP family metal-dependent phosphoesterase  32.97 
 
 
284 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  33.82 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  30.69 
 
 
286 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  33.6 
 
 
286 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  31.94 
 
 
286 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  30.58 
 
 
286 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  35.86 
 
 
280 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1622  phosphotransferase domain-containing protein  35.6 
 
 
278 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0489037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  32.61 
 
 
270 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  32.42 
 
 
281 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1736  PHP domain protein  33.2 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1562  PHP domain protein  34.73 
 
 
287 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  32.3 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1492  PHP C-terminal domain protein  34.78 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0511  phosphoesterase PHP, N-terminal  35.42 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.369716  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  33.2 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1356  phosphotransferase domain-containing protein  34.78 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1092  metal-dependent phosphoesterase  32.02 
 
 
314 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201049  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3835  PHP domain protein  33.8 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1270  hypothetical protein  32.41 
 
 
280 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1553  phosphoesterase PHP-like  32.27 
 
 
297 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.653581  normal  0.211268 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1744  PHP domain protein  31.91 
 
 
286 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1326  PHP domain protein  31.32 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00676626  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1610  phosphotransferase domain-containing protein  33.6 
 
 
287 aa  130  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  33.09 
 
 
288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0717  PHP domain protein  33.33 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0221894  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  34.43 
 
 
285 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  30.52 
 
 
279 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1231  PHP-like  30.68 
 
 
281 aa  125  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000070762  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2618  phosphotransferase domain-containing protein  31.32 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1793  phosphoesterase PHP-like  32.25 
 
 
277 aa  125  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322094  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5249  PHP domain protein  32.96 
 
 
272 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.815864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3606  PHP domain protein  29.01 
 
 
279 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1397  hypothetical protein  30.92 
 
 
279 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2756  hypothetical protein  32.31 
 
 
287 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.308411  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1503  phosphotransferase domain-containing protein  31.92 
 
 
294 aa  122  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0032645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1878  phosphotransferase domain-containing protein  31.01 
 
 
288 aa  122  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1973  PHP-like  29.29 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425716  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0261  phosphotransferase domain-containing protein  30.92 
 
 
270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0890  hypothetical protein  34.02 
 
 
253 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347424  normal  0.445222 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0994  PHP domain protein  31.01 
 
 
283 aa  119  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000016176  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2311  PHP domain protein  33.33 
 
 
285 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000176637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3521  phosphotransferase domain-containing protein  32.85 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1975  PHP-like  31.94 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000544393  normal  0.0436962 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1985  phosphotransferase domain-containing protein  29.03 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000791669 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1912  PHP domain protein  33.33 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.657116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1266  PHP domain protein  32 
 
 
283 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2582  phosphoesterase, PHP-like  32 
 
 
283 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1367  PHP domain protein  32 
 
 
283 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0662  phosphotransferase domain-containing protein  30.94 
 
 
294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1536  PHP domain protein  29.57 
 
 
274 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1448  phosphotransferase domain-containing protein  32.71 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216828  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3436  phosphotransferase domain-containing protein  32.82 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3094  phosphoesterase PHP-like  33.73 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0844  phosphotransferase domain-containing protein  32.53 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3707  phosphotransferase domain-containing protein  31.89 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2763  PHP domain protein  29.33 
 
 
292 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3431  phosphotransferase domain-containing protein  29.33 
 
 
292 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1697  PHP family metal-dependent phosphoesterase  28.57 
 
 
293 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1718  hypothetical protein  31.27 
 
 
278 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2402  hypothetical protein  28.74 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2114  hypothetical protein  28.74 
 
 
272 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3274  phosphotransferase domain-containing protein  31.75 
 
 
287 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156936  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0909  metal-dependent phosphoesterase  31.4 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.531457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>