223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0890 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0890  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  501  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347424  normal  0.445222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3826  PHP-like  72.33 
 
 
289 aa  316  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.596413  normal  0.059434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  53.17 
 
 
280 aa  236  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1796  phosphotransferase domain-containing protein  51.18 
 
 
284 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.757775  normal  0.756864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7822  PHP domain protein  47.51 
 
 
288 aa  221  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4259  PHP domain protein  50.99 
 
 
294 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06590  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  50.4 
 
 
295 aa  205  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366833  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  47.95 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0511  phosphoesterase PHP, N-terminal  52.28 
 
 
290 aa  195  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.369716  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1793  phosphoesterase PHP-like  45.06 
 
 
277 aa  192  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322094  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7842  phosphotransferase domain-containing protein  48.41 
 
 
284 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2164  PHP domain protein  43.48 
 
 
287 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  hitchhiker  0.000429759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0681  phosphotransferase domain-containing protein  47.54 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255155  normal  0.888291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3835  PHP domain protein  43.56 
 
 
291 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0820  PHP domain protein  45.42 
 
 
285 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000400643  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  45.56 
 
 
285 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0704  PHP domain protein  43.43 
 
 
280 aa  169  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15290  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  43.7 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00297509  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27790  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  44.92 
 
 
284 aa  159  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0386409  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2507  PHP domain protein  40.23 
 
 
282 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2787  phosphotransferase domain-containing protein  42.06 
 
 
282 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0771  PHP domain protein  45.49 
 
 
279 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2480  PHP domain protein  44.49 
 
 
280 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0141576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2909  PHP domain protein  45.9 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308532  normal  0.0259754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11310  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  40.94 
 
 
294 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0363713  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  34.8 
 
 
286 aa  143  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  36.28 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1471  PHP domain protein  38.55 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1736  PHP domain protein  35.74 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  33.92 
 
 
286 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  35.56 
 
 
286 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1465  phosphotransferase domain-containing protein  39.77 
 
 
296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  33.48 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  35.4 
 
 
286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  34.07 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1492  PHP C-terminal domain protein  32.93 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  40.98 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1356  phosphotransferase domain-containing protein  33.2 
 
 
287 aa  132  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1562  PHP domain protein  36.32 
 
 
287 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1610  phosphotransferase domain-containing protein  32.4 
 
 
287 aa  131  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1914  phosphotransferase domain-containing protein  38.39 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.629211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3099  PHP domain protein  33.77 
 
 
286 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000891191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1622  phosphotransferase domain-containing protein  31.5 
 
 
278 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0489037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0107  putative metal-dependent phosphoesterse  34.01 
 
 
297 aa  121  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  34.66 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  36.49 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1266  PHP domain protein  39.64 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1367  PHP domain protein  39.64 
 
 
283 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2582  phosphoesterase, PHP-like  39.19 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320508  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0442  PHP domain protein  34.02 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000416884 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1639  phosphotransferase domain-containing protein  29.73 
 
 
275 aa  118  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1278  phosphotransferase domain-containing protein  37.33 
 
 
279 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0662  phosphotransferase domain-containing protein  27.15 
 
 
267 aa  118  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1248  PHP family metal-dependent phosphoesterase  30.93 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19240  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  37.75 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0196602  hitchhiker  0.0091278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  35.74 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  33.78 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2618  phosphotransferase domain-containing protein  33.05 
 
 
291 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  31.56 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  29.26 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1553  phosphoesterase PHP-like  35.15 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.653581  normal  0.211268 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  30.43 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1503  phosphotransferase domain-containing protein  31.1 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0032645  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  32.23 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1975  PHP-like  34.89 
 
 
293 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000544393  normal  0.0436962 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  29.78 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1326  PHP domain protein  31.91 
 
 
286 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00676626  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1536  PHP domain protein  34.5 
 
 
274 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0717  PHP domain protein  31.98 
 
 
291 aa  105  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0221894  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1479  PHP domain protein  29.26 
 
 
276 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00132701  normal  0.722152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1448  phosphotransferase domain-containing protein  32.48 
 
 
288 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1878  phosphotransferase domain-containing protein  36.65 
 
 
288 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1718  hypothetical protein  36.2 
 
 
278 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1912  PHP domain protein  34.47 
 
 
293 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.657116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5748  PHP domain protein  34.58 
 
 
299 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3606  PHP domain protein  27.39 
 
 
279 aa  99.4  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2808  phosphotransferase domain-containing protein  33.19 
 
 
288 aa  98.6  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000695757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2311  PHP domain protein  33.19 
 
 
285 aa  95.9  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000176637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1810  PHP domain protein  31.54 
 
 
287 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3436  phosphotransferase domain-containing protein  28.27 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0883  TrpH protein  29.05 
 
 
269 aa  92.4  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.33957  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1985  phosphotransferase domain-containing protein  31.91 
 
 
309 aa  92.4  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000791669 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0712  PHP domain protein  27.43 
 
 
290 aa  92  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2828  PHP-like  30.8 
 
 
288 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1941  PHP domain protein  32.91 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3586  phosphoesterase PHP, N-terminal:PHP, C-terminal  32.46 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0235  PHP domain protein  32.02 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2128  PHP-like protein  33.04 
 
 
286 aa  89.7  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  33.18 
 
 
288 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3094  phosphoesterase PHP-like  29.09 
 
 
289 aa  89  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1926  hypothetical protein  35.44 
 
 
295 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1834  phosphotransferase domain-containing protein  33.2 
 
 
303 aa  89  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.423951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1270  hypothetical protein  27.13 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1744  PHP domain protein  30.18 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2309  PHP domain protein  29.46 
 
 
290 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1092  metal-dependent phosphoesterase  26.36 
 
 
314 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201049  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0261  phosphotransferase domain-containing protein  31.08 
 
 
270 aa  87  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1487  PHP-like  32.75 
 
 
287 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22820  PHP domain-containing protein  34.14 
 
 
295 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.141448 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02287  PHP domain protein  30.49 
 
 
297 aa  85.9  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.624872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>