More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2311 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2311  PHP domain protein  100 
 
 
285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000176637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1912  PHP domain protein  95.02 
 
 
293 aa  521  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.657116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2808  phosphotransferase domain-containing protein  59.14 
 
 
288 aa  345  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000695757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1448  phosphotransferase domain-containing protein  53.43 
 
 
288 aa  317  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1975  PHP-like  50.88 
 
 
293 aa  315  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000544393  normal  0.0436962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1326  PHP domain protein  47.65 
 
 
286 aa  278  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00676626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0909  metal-dependent phosphoesterase  51.07 
 
 
291 aa  278  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.531457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0662  phosphotransferase domain-containing protein  46.01 
 
 
294 aa  266  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  39.22 
 
 
282 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  40 
 
 
281 aa  185  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  39.58 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0717  PHP domain protein  38.11 
 
 
291 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0221894  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1622  phosphotransferase domain-containing protein  35.42 
 
 
278 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0489037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1562  PHP domain protein  38.1 
 
 
287 aa  171  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  36.3 
 
 
286 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1914  phosphotransferase domain-containing protein  38.52 
 
 
275 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.629211  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  38.32 
 
 
279 aa  169  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  38.43 
 
 
279 aa  168  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3436  phosphotransferase domain-containing protein  34.28 
 
 
287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1471  PHP domain protein  42.08 
 
 
273 aa  166  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3606  PHP domain protein  35.43 
 
 
279 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3099  PHP domain protein  39.57 
 
 
286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000891191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1503  phosphotransferase domain-containing protein  35.66 
 
 
294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0032645  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  34.64 
 
 
286 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  36.46 
 
 
288 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1356  phosphotransferase domain-containing protein  37.55 
 
 
287 aa  162  7e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  40.23 
 
 
285 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  33.93 
 
 
270 aa  158  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1492  PHP C-terminal domain protein  36.02 
 
 
287 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1744  PHP domain protein  36.17 
 
 
286 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  33.45 
 
 
286 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  35.41 
 
 
264 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  32.97 
 
 
286 aa  155  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1610  phosphotransferase domain-containing protein  36.4 
 
 
287 aa  155  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  35.46 
 
 
275 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  33.81 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1639  phosphotransferase domain-containing protein  35.11 
 
 
275 aa  153  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  34.63 
 
 
286 aa  152  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1536  PHP domain protein  37.23 
 
 
274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  40.23 
 
 
280 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0712  PHP domain protein  37.14 
 
 
290 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2507  PHP domain protein  36.36 
 
 
282 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3094  phosphoesterase PHP-like  37.99 
 
 
289 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  38.89 
 
 
270 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0662  phosphotransferase domain-containing protein  33.46 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2618  phosphotransferase domain-containing protein  35.82 
 
 
291 aa  145  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5748  PHP domain protein  36.5 
 
 
299 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2164  PHP domain protein  38.58 
 
 
287 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  hitchhiker  0.000429759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1465  phosphotransferase domain-containing protein  39.69 
 
 
296 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  35.8 
 
 
278 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1248  PHP family metal-dependent phosphoesterase  31.8 
 
 
284 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1736  PHP domain protein  33.92 
 
 
286 aa  142  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19240  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  36.36 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0196602  hitchhiker  0.0091278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  32.94 
 
 
279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15290  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  34.49 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00297509  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  36.46 
 
 
284 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  33.22 
 
 
280 aa  135  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0511  phosphoesterase PHP, N-terminal  40.3 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.369716  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06590  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  39.62 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366833  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1092  metal-dependent phosphoesterase  29.29 
 
 
314 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201049  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1553  phosphoesterase PHP-like  35.31 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.653581  normal  0.211268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2128  PHP-like protein  35.43 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1397  hypothetical protein  33.09 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2480  PHP domain protein  37.06 
 
 
280 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0141576 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1941  PHP domain protein  35.13 
 
 
289 aa  133  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1665  PHP domain protein  35.98 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0193583  hitchhiker  0.000506182 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1270  hypothetical protein  28.93 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3586  phosphoesterase PHP, N-terminal:PHP, C-terminal  31.91 
 
 
287 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2800  phosphotransferase domain-containing protein  35.98 
 
 
302 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660004  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2721  phosphotransferase domain-containing protein  35.98 
 
 
302 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  32 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2402  phosphotransferase domain-containing protein  36.36 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1810  PHP domain protein  31.52 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0442  PHP domain protein  33.73 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000416884 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1878  phosphotransferase domain-containing protein  35.29 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1479  PHP domain protein  33.07 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00132701  normal  0.722152 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2646  PHP domain protein  35.64 
 
 
294 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2700  phosphotransferase domain-containing protein  35.61 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3835  PHP domain protein  35.32 
 
 
291 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0107  putative metal-dependent phosphoesterse  33.72 
 
 
297 aa  128  9.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1718  hypothetical protein  35.02 
 
 
278 aa  128  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4500  trpH family protein  33.73 
 
 
286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655584  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7822  PHP domain protein  33.82 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1412  phosphotransferase domain-containing protein  33.86 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0394495  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15640  Phosphoesterase (PHP family)  33.99 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11310  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  39.84 
 
 
294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0363713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1487  PHP-like  31.91 
 
 
287 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1141  PHP-like  31.95 
 
 
291 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000994847  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4006  phosphotransferase domain-containing protein  32.94 
 
 
286 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000044787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1796  phosphotransferase domain-containing protein  37.64 
 
 
284 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.757775  normal  0.756864 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1266  PHP domain protein  36.04 
 
 
283 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1973  PHP-like  34.2 
 
 
315 aa  123  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425716  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  35.88 
 
 
280 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3789  phosphotransferase domain-containing protein  32.55 
 
 
286 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000806386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  32.3 
 
 
286 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  32.3 
 
 
286 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1877  PHP-like protein  33.96 
 
 
284 aa  122  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1278  phosphotransferase domain-containing protein  34.39 
 
 
279 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2828  PHP-like  29.96 
 
 
288 aa  122  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22820  PHP domain-containing protein  33.46 
 
 
295 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.141448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>