21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1243 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1243  hypothetical protein  100 
 
 		 743 aa  1508    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  28.65 
 
 		 966 aa  223  7e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  27.27 
 
 		 938 aa  190  7e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  30.54 
 
 		 995 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  25.82 
 
 		 972 aa  163  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  30.4 
 
 		 897 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  30.46 
 
 		 888 aa  137  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  25.79 
 
 		 992 aa  124  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  25.15 
 
 		 937 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  24.73 
 
 		 916 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  26.1 
 
 		 1028 aa  108  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  25.41 
 
 		 990 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  24.41 
 
 		 1028 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  26.87 
 
 		 1011 aa  104  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  27.46 
 
 		 853 aa  83.2  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  23.8 
 
 		 895 aa  55.1  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  37.66 
 
 		 428 aa  50.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  32.32 
 
 		 896 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  23.44 
 
 		 894 aa  48.5  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5585  hypothetical protein  23.87 
 
 		 258 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0168828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  36.26 
 
 		 892 aa  44.7  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>