More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2338 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2338  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 
241 aa  481  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.885404  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3141  phosphotransferase domain-containing protein  83.9 
 
 
240 aa  378  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3529  PHP domain protein  47.98 
 
 
235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0293  phosphotransferase domain-containing protein  35.81 
 
 
297 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.704533  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1268  phosphotransferase domain-containing protein  35.44 
 
 
295 aa  121  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0789  phosphotransferase domain-containing protein  36.87 
 
 
216 aa  121  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  39.83 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0698  phosphotransferase domain-containing protein  35.61 
 
 
299 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2713  PHP domain protein  40.39 
 
 
221 aa  119  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  35.71 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1258  phosphotransferase domain-containing protein  34.47 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.331098  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2412  PHP-like protein  38.54 
 
 
223 aa  116  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.177718  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1418  phosphotransferase domain-containing protein  34.47 
 
 
299 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.105026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2401  PHP-like  38.61 
 
 
221 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0352  isoleucyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3292  PHP domain protein  42.37 
 
 
244 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0400  PHP domain protein  35.35 
 
 
225 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  32.78 
 
 
232 aa  104  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2121  PHP domain protein  36.61 
 
 
308 aa  102  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1753  PHP domain protein  36.82 
 
 
228 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0095  PHP domain protein  33.17 
 
 
216 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.411706  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0713  phosphotransferase domain-containing protein  30.94 
 
 
219 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3680  PHP domain protein  35.89 
 
 
249 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  36.57 
 
 
228 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_620  PHP domain protein  30.5 
 
 
219 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2010  PHP-like protein  33.92 
 
 
247 aa  99.4  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0799075  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3538  PHP domain protein  35.82 
 
 
228 aa  99.8  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0648  phosphotransferase domain-containing protein  30.39 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2007  PHP domain protein  33.89 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1312  PHP domain protein  35.18 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250099  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1414  hypothetical protein  30.32 
 
 
214 aa  96.3  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00470799  normal  0.0153029 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1860  PHP domain protein  32.99 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1701  phosphotransferase domain-containing protein  31.66 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  0.300647 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3528  PHP domain protein  40.11 
 
 
226 aa  92.8  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1404  hypothetical protein  31.25 
 
 
215 aa  92  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132129  normal  0.334208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0789  PHP domain protein  38.1 
 
 
640 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0255666 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0612  PHP domain protein  34.72 
 
 
227 aa  86.3  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.138908  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1597  phosphotransferase domain-containing protein  33.7 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667137  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0385  PHP-like  30.94 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.838582  normal  0.0911256 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0733  PHP domain protein  33.52 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.910762  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1467  PHP domain protein  33.5 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2482  hypothetical protein  31.28 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2487  phosphoesterase, PHP-like  33 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1370  PHP domain protein  33 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0668  phosphotransferase domain-containing protein  27.4 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1914  phosphotransferase domain-containing protein  54.69 
 
 
275 aa  72  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.629211  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1381  phosphotransferase domain-containing protein  32.7 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52337  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3849  phosphotransferase domain-containing protein  32.44 
 
 
497 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0580  PHP domain protein  28.19 
 
 
244 aa  67  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1232  PHP-like  29.48 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.469628  normal  0.0397506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2621  phosphotransferase domain-containing protein  34.25 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.88374  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1841  phosphotransferase domain-containing protein  34.88 
 
 
382 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2823  PHP domain protein  31.48 
 
 
352 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1172  PHP domain protein  33.08 
 
 
353 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0555616 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  40.54 
 
 
279 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1718  PHP domain protein  34.38 
 
 
407 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2550  phosphotransferase domain-containing protein  32.61 
 
 
352 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.393848  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  36.05 
 
 
286 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1431  phosphotransferase domain-containing protein  30.17 
 
 
452 aa  60.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.208412  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1744  PHP domain protein  46.75 
 
 
286 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1365  phosphotransferase domain-containing protein  22.69 
 
 
214 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222965  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0649  hypothetical protein  30 
 
 
809 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00490062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  46.03 
 
 
275 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  40.51 
 
 
281 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0474  PHP domain protein  34.73 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.373007  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  37.8 
 
 
286 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1254  phosphoesterase PHP-like  29.7 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  37.8 
 
 
286 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1261  phosphotransferase domain-containing protein  27.08 
 
 
214 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  36.59 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1644  phosphotransferase domain-containing protein  43.06 
 
 
292 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  38.55 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  30.11 
 
 
458 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  30.48 
 
 
460 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1139  PHP domain protein  31.67 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0442  PHP domain protein  38.27 
 
 
321 aa  57.4  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000416884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  24.76 
 
 
584 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3436  phosphotransferase domain-containing protein  40.91 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15640  Phosphoesterase (PHP family)  36.46 
 
 
287 aa  55.8  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  42.67 
 
 
285 aa  55.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0533  phosphotransferase domain-containing protein  27.32 
 
 
214 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0404  PHP domain protein  37.5 
 
 
276 aa  55.5  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.279264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  33.72 
 
 
286 aa  55.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1973  PHP-like  40.91 
 
 
315 aa  55.1  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425716  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  25 
 
 
480 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3606  PHP domain protein  33.75 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1471  PHP domain protein  43.9 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0776  PHP domain protein  28.44 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1834  phosphotransferase domain-containing protein  36.26 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.423951 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  38.46 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2957  PHP domain protein  42.11 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1622  phosphotransferase domain-containing protein  37.18 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0489037  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  33.72 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2555  PHP domain protein  27.72 
 
 
425 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.301394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3099  PHP domain protein  38.81 
 
 
286 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000891191  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1697  PHP family metal-dependent phosphoesterase  42.19 
 
 
293 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0378  phosphotransferase domain-containing protein  28.47 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000646599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2521  PHP domain protein  28.33 
 
 
331 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.428127 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0235  PHP domain protein  39.29 
 
 
262 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0133  PHP domain protein  24.38 
 
 
233 aa  52.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000000141938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>