79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1616 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1616  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  690    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1229  hypothetical protein  50.78 
 
 
332 aa  343  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00281517  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
803 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2401  PHP-like  28.17 
 
 
221 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
819 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  33.33 
 
 
286 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
812 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  34.78 
 
 
286 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  30.56 
 
 
286 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  27.76 
 
 
803 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  32.65 
 
 
286 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  29.25 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1492  PHP C-terminal domain protein  30.7 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1356  phosphotransferase domain-containing protein  31.37 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1597  phosphotransferase domain-containing protein  27.89 
 
 
221 aa  50.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667137  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3521  phosphotransferase domain-containing protein  30 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1610  phosphotransferase domain-containing protein  31.52 
 
 
287 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  24.43 
 
 
816 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  35.24 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  32.65 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1490  putative phosphoesterase  27.16 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  24.54 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3292  PHP domain protein  38.55 
 
 
244 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  33.33 
 
 
285 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  23.81 
 
 
480 aa  46.6  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1898  putative phosphoesterase  27.16 
 
 
293 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000460558 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1553  phosphoesterase PHP-like  34.04 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.653581  normal  0.211268 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1479  PHP domain protein  36.14 
 
 
276 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00132701  normal  0.722152 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1867  putative phosphoesterase  27.16 
 
 
293 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000652478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2621  phosphotransferase domain-containing protein  25.52 
 
 
266 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.88374  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1465  putative phosphoesterase  27.16 
 
 
286 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.200678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1375  putative phosphoesterase  26.64 
 
 
286 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11310  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  29.1 
 
 
294 aa  46.2  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0363713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2362  phosphotransferase domain-containing protein  27.16 
 
 
293 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2383  PHP domain protein  27.16 
 
 
293 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00108738  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
816 aa  45.8  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01240  hypothetical protein  27.16 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  30.91 
 
 
279 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  33.33 
 
 
264 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  25.82 
 
 
225 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01250  hypothetical protein  27.16 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1064  PHP-like protein  36.67 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2584  hypothetical protein  27.07 
 
 
777 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0639598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1878  phosphotransferase domain-containing protein  29.9 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1312  AAA-4 family protein  38.6 
 
 
774 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201459  normal  0.370509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
827 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  31.68 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1641  AAA-4 family protein  39.62 
 
 
773 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.49775  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  32.98 
 
 
486 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1736  PHP domain protein  30.61 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  38.1 
 
 
280 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
772 aa  44.3  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0662  phosphotransferase domain-containing protein  33.33 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2721  phosphotransferase domain-containing protein  31.48 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
810 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1665  PHP domain protein  31.48 
 
 
286 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0193583  hitchhiker  0.000506182 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2800  phosphotransferase domain-containing protein  31.48 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660004  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1914  phosphotransferase domain-containing protein  29.57 
 
 
275 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.629211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22820  PHP domain-containing protein  31.13 
 
 
295 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.141448 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  35.87 
 
 
228 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2785  PHP domain protein  32.86 
 
 
230 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1141  PHP-like  31.03 
 
 
291 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000994847  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3316  PHP domain protein  32.86 
 
 
230 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.247221 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2402  phosphotransferase domain-containing protein  30.51 
 
 
286 aa  43.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  36.49 
 
 
285 aa  43.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  36.76 
 
 
232 aa  43.1  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7842  phosphotransferase domain-containing protein  44.9 
 
 
284 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2128  PHP-like protein  33.71 
 
 
286 aa  43.1  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1231  PHP-like  28.33 
 
 
281 aa  43.1  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000070762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3099  PHP domain protein  31.52 
 
 
286 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000891191  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1007  hypothetical protein  27.31 
 
 
771 aa  43.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2700  phosphotransferase domain-containing protein  31.48 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1425  putative phosphoesterase  35.16 
 
 
282 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.769482  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1853  putative phosphoesterase  35.16 
 
 
282 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  31.46 
 
 
278 aa  42.7  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1911  putative phosphoesterase  35.16 
 
 
282 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000200072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1463  phosphotransferase domain-containing protein  32.71 
 
 
286 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1607  putative phosphoesterase  35.16 
 
 
282 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728178 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1848  putative phosphoesterase  35.16 
 
 
282 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  hitchhiker  0.000620806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>