More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5419 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  424  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  75.98 
 
 		 204 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  74.51 
 
 		 217 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  74.02 
 
 		 217 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  74.02 
 
 		 217 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  72.51 
 
 		 217 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  77.95 
 
 		 195 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 		 204 aa  305  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  66.35 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  75.51 
 
 		 208 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  73.5 
 
 		 208 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  63.96 
 
 		 203 aa  258  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  63.59 
 
 		 202 aa  256  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  56 
 
 		 200 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  54.04 
 
 		 210 aa  225  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  56.35 
 
 		 204 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  55.12 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 202 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 203 aa  131  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  35.79 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 198 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 202 aa  99  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  31.22 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 289 aa  68.6  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  32.53 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  29.85 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  26.99 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  47.37 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
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NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
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NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
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NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30.06 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  45.16 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
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