232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1203 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  96.06 
 
 		 203 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 190 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  30.32 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  28.07 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  48.39 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 770 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  26.22 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  24.58 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  27.18 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 257 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 271 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10300  transcriptional regulator, tetR family  32.67 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  29.7 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  29.57 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 421 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 251 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1262  hypothetical protein  42.19 
 
 		 233 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.683399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 288 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  24.02 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  20.25 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  26.83 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  26.56 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  22.29 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>