More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1495 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  100 
 
 
556 aa  1142    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  51.62 
 
 
560 aa  529  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  50.37 
 
 
539 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  48.66 
 
 
568 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  49.64 
 
 
567 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  46.75 
 
 
566 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  46.91 
 
 
570 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  46.21 
 
 
563 aa  488  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  49.73 
 
 
567 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  46.57 
 
 
593 aa  482  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  47.59 
 
 
604 aa  479  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  48.47 
 
 
571 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  45.66 
 
 
605 aa  478  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  47.2 
 
 
570 aa  472  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  47.19 
 
 
572 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  47.74 
 
 
538 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  45.41 
 
 
607 aa  454  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  47.35 
 
 
540 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  47.85 
 
 
563 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  50.18 
 
 
560 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  46.72 
 
 
531 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  46.75 
 
 
533 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  50.21 
 
 
507 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  47.64 
 
 
522 aa  452  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  47.76 
 
 
544 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  47.21 
 
 
546 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  44.75 
 
 
524 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  44.68 
 
 
587 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  48.16 
 
 
576 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  48.49 
 
 
565 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  46.67 
 
 
538 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  47.54 
 
 
550 aa  435  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  45.31 
 
 
599 aa  431  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  42.64 
 
 
609 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  44.18 
 
 
533 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  45.92 
 
 
545 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  45.93 
 
 
555 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  50.32 
 
 
555 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  47.37 
 
 
532 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  50.61 
 
 
511 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  44.81 
 
 
560 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  44.32 
 
 
544 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  45.36 
 
 
543 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  45.7 
 
 
539 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  49.69 
 
 
554 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  45.34 
 
 
539 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  43.95 
 
 
534 aa  415  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  45.34 
 
 
539 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  45.75 
 
 
561 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  44.73 
 
 
546 aa  411  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  46.37 
 
 
543 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  42.56 
 
 
640 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  45.57 
 
 
549 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  43.56 
 
 
553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  45.9 
 
 
558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  43.36 
 
 
561 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  45.83 
 
 
512 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  46.37 
 
 
554 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  44.19 
 
 
548 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  48.01 
 
 
594 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  43.14 
 
 
573 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  43.89 
 
 
542 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  42.06 
 
 
634 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  43.34 
 
 
580 aa  357  5e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  40.48 
 
 
544 aa  350  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  41.35 
 
 
543 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  40.14 
 
 
536 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  42.44 
 
 
540 aa  326  7e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  44.22 
 
 
548 aa  324  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  42.31 
 
 
529 aa  323  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  40.69 
 
 
553 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  39.87 
 
 
543 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  40.88 
 
 
538 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  40.74 
 
 
532 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  42.95 
 
 
540 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  41.56 
 
 
538 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  43.27 
 
 
541 aa  310  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  39.71 
 
 
545 aa  309  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  43.45 
 
 
542 aa  307  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  42.46 
 
 
541 aa  307  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  40.51 
 
 
524 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  36.25 
 
 
525 aa  300  5e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  39.29 
 
 
537 aa  300  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  42.68 
 
 
448 aa  299  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  39.39 
 
 
548 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  39.96 
 
 
550 aa  296  7e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  43.95 
 
 
535 aa  296  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  42.79 
 
 
540 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  39.67 
 
 
547 aa  295  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  37.65 
 
 
535 aa  294  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  37.34 
 
 
548 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  38.22 
 
 
530 aa  294  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  39.17 
 
 
549 aa  293  6e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  41.89 
 
 
528 aa  293  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  38.78 
 
 
544 aa  292  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  40.72 
 
 
542 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  40.17 
 
 
533 aa  291  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.12 
 
 
551 aa  291  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  37.13 
 
 
555 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  36.67 
 
 
541 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>