115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0648 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 196 aa  114  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 217 aa  73.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 208 aa  70.9  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 230 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  21.67 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 243 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  27.03 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  27.59 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 215 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  24.63 
 
 		 199 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 226 aa  50.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 208 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 208 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 244 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 244 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 244 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  25.17 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 214 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 264 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 216 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  47.8  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  27.14 
 
 		 190 aa  47.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 186 aa  47.4  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  28.38 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  29.37 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 208 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 219 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 203 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 195 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 209 aa  44.7  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 205 aa  44.3  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  25.19 
 
 		 227 aa  44.3  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  23.29 
 
 		 241 aa  44.3  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  27.59 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3474  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.990992  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0501  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.480273  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 240 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 204 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 195 aa  42  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 222 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 224 aa  42  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 209 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 209 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 196 aa  41.6  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 218 aa  41.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  37.21 
 
 		 343 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 186 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 212 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 195 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>