More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0399 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  41.15 
 
 		 1153 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  41.91 
 
 		 1151 aa  647    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  40.57 
 
 		 1153 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  41.57 
 
 		 1152 aa  682    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  42.49 
 
 		 1153 aa  687    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1165 aa  2222    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  41.65 
 
 		 1152 aa  686    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  40.13 
 
 		 1154 aa  648    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  41.18 
 
 		 1151 aa  666    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  40.37 
 
 		 1154 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  40.41 
 
 		 1151 aa  644    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  40.53 
 
 		 1150 aa  636    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  41.21 
 
 		 1153 aa  635  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  40.58 
 
 		 1154 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  41.8 
 
 		 1153 aa  632  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  40.13 
 
 		 1154 aa  622  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  40.15 
 
 		 1170 aa  619  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  39.85 
 
 		 1168 aa  615  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  40.45 
 
 		 1154 aa  612  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  41.2 
 
 		 1150 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.26 
 
 		 1176 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  38.77 
 
 		 1152 aa  419  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  56.88 
 
 		 1511 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  28.05 
 
 		 1169 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.05 
 
 		 1169 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  30.59 
 
 		 1162 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.15 
 
 		 1177 aa  389  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  30.55 
 
 		 1162 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  44.23 
 
 		 1167 aa  376  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  30.42 
 
 		 1167 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  30.04 
 
 		 1167 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  39.59 
 
 		 1150 aa  372  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.93 
 
 		 1187 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  30.47 
 
 		 1167 aa  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  31.88 
 
 		 1170 aa  365  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  30.89 
 
 		 1167 aa  361  4e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  31.01 
 
 		 1171 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1164 aa  355  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  32.75 
 
 		 1175 aa  353  8.999999999999999e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  32.23 
 
 		 1167 aa  353  1e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.19 
 
 		 1191 aa  352  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  26.79 
 
 		 1186 aa  347  7e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.27 
 
 		 1187 aa  345  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  37.82 
 
 		 1170 aa  345  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  39.3 
 
 		 1140 aa  338  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  38.57 
 
 		 1151 aa  336  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  38.81 
 
 		 1170 aa  334  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  26.18 
 
 		 1148 aa  333  1e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  27.38 
 
 		 1177 aa  318  3e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.12 
 
 		 1179 aa  317  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.73 
 
 		 1179 aa  313  1e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  27.01 
 
 		 1178 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  47.9 
 
 		 1152 aa  295  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.08 
 
 		 1181 aa  289  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  49.32 
 
 		 1147 aa  289  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  55.14 
 
 		 1147 aa  277  8e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  56.03 
 
 		 1153 aa  277  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  61.03 
 
 		 1148 aa  271  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  55.9 
 
 		 1148 aa  268  5.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  60.71 
 
 		 1144 aa  250  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  46.72 
 
 		 1167 aa  247  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  45.87 
 
 		 1176 aa  222  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  36.88 
 
 		 1176 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  33.4 
 
 		 1173 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  46.02 
 
 		 1138 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  47.77 
 
 		 814 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  41.25 
 
 		 1176 aa  216  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  46.02 
 
 		 1138 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  46.02 
 
 		 1138 aa  216  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  46.02 
 
 		 1138 aa  216  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  30.86 
 
 		 1195 aa  214  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  34.96 
 
 		 1199 aa  214  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  44.44 
 
 		 1175 aa  213  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  35.13 
 
 		 1199 aa  213  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1133 aa  213  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  30.59 
 
 		 1177 aa  209  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  30.39 
 
 		 1162 aa  208  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  45.83 
 
 		 1190 aa  208  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  43.94 
 
 		 1190 aa  208  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  45.91 
 
 		 1198 aa  207  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  44.2 
 
 		 1185 aa  206  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  46.08 
 
 		 1185 aa  206  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  32.16 
 
 		 1165 aa  204  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  43.37 
 
 		 1164 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  27.11 
 
 		 1144 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  47.03 
 
 		 1177 aa  203  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  33.53 
 
 		 1162 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  42.17 
 
 		 1190 aa  202  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  33.53 
 
 		 1162 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  41.77 
 
 		 1164 aa  201  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  34.25 
 
 		 1142 aa  201  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  33.24 
 
 		 1162 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  33.01 
 
 		 1145 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  32.94 
 
 		 1162 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  33.59 
 
 		 1142 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  42.28 
 
 		 1176 aa  200  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  42.31 
 
 		 1199 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.81 
 
 		 1178 aa  200  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  33.84 
 
 		 1142 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  36.73 
 
 		 1234 aa  199  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>