More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1291 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 912 aa  1813    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 910 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 907 aa  243  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  29.46 
 
 		 908 aa  205  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 926 aa  144  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  24.39 
 
 		 893 aa  104  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  29.79 
 
 		 845 aa  101  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  26.82 
 
 		 864 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  24.37 
 
 		 884 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  26.05 
 
 		 867 aa  75.5  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 880 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  25.81 
 
 		 562 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 894 aa  70.1  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  23.35 
 
 		 893 aa  68.2  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  23.86 
 
 		 865 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  64.71 
 
 		 907 aa  63.9  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  48.19 
 
 		 919 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 876 aa  62  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  57.41 
 
 		 904 aa  61.6  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  55.36 
 
 		 919 aa  61.6  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 856 aa  61.2  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  53.23 
 
 		 955 aa  60.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  25.74 
 
 		 871 aa  60.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  43.53 
 
 		 918 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 879 aa  60.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  57.41 
 
 		 884 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  56.86 
 
 		 903 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  43.62 
 
 		 884 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 920 aa  59.3  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  56 
 
 		 928 aa  59.7  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 889 aa  59.7  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  38.85 
 
 		 895 aa  58.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 909 aa  58.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  56.86 
 
 		 905 aa  58.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 814 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  50.88 
 
 		 923 aa  58.2  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  44.3 
 
 		 995 aa  57.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  56.6 
 
 		 1001 aa  57.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  48.28 
 
 		 940 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2039  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 917 aa  57  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  54.9 
 
 		 934 aa  57.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1063  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 917 aa  57  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  56.25 
 
 		 956 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  43.68 
 
 		 212 aa  57.4  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1348  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 917 aa  57  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.554665  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2330  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 917 aa  57  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 1085 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  43.37 
 
 		 940 aa  57  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1436  GerE family regulatory protein  36.84 
 
 		 921 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 959 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 228 aa  56.6  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 929 aa  57  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34130  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.96 
 
 		 853 aa  56.6  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  59.18 
 
 		 998 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  52.94 
 
 		 827 aa  55.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  44.05 
 
 		 959 aa  56.2  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  29.15 
 
 		 903 aa  56.2  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  41.67 
 
 		 919 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3097  LuxR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 898 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0989415  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 937 aa  55.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  52.94 
 
 		 937 aa  55.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  52.94 
 
 		 937 aa  55.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 775 aa  55.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  42.53 
 
 		 212 aa  55.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 865 aa  55.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 950 aa  55.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  49.12 
 
 		 961 aa  54.7  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 953 aa  54.7  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 946 aa  54.7  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 454 aa  54.7  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 508 aa  54.7  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.02 
 
 		 881 aa  54.7  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  48.15 
 
 		 930 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  45.16 
 
 		 917 aa  54.7  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 923 aa  54.3  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 910 aa  54.3  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  47.27 
 
 		 221 aa  54.7  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  46.3 
 
 		 471 aa  54.7  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 897 aa  54.3  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.02 
 
 		 223 aa  53.9  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253855  normal  0.0592312 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.32 
 
 		 914 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  50 
 
 		 955 aa  53.9  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 228 aa  54.3  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 799 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 894 aa  53.9  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 215 aa  54.3  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 960 aa  54.3  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  50.98 
 
 		 884 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 928 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 215 aa  53.9  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 217 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  23.84 
 
 		 868 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 210 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  58 
 
 		 911 aa  53.9  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 997 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0656  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 218 aa  53.5  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.214241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  40.23 
 
 		 233 aa  53.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 927 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 257 aa  53.5  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>