123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0496 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  100 
 
 		 686 aa  1388    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  35.76 
 
 		 730 aa  302  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  50.47 
 
 		 347 aa  295  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  50.92 
 
 		 794 aa  260  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  50.99 
 
 		 474 aa  254  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  46 
 
 		 627 aa  244  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  42.99 
 
 		 560 aa  234  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  44.59 
 
 		 334 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  41.82 
 
 		 376 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  41.77 
 
 		 567 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  41.4 
 
 		 487 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  37.65 
 
 		 447 aa  191  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  40.37 
 
 		 457 aa  189  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  37.54 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  35.28 
 
 		 326 aa  179  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  34.71 
 
 		 322 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  38.01 
 
 		 439 aa  161  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  34.25 
 
 		 644 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  35.31 
 
 		 746 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  35.07 
 
 		 361 aa  156  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  35.07 
 
 		 361 aa  156  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  32.73 
 
 		 326 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  32.95 
 
 		 345 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  33.43 
 
 		 338 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  35.07 
 
 		 361 aa  155  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  34.63 
 
 		 366 aa  154  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  33.63 
 
 		 368 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  33.93 
 
 		 368 aa  151  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  33.54 
 
 		 666 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  34.15 
 
 		 337 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  31.76 
 
 		 365 aa  143  9e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  35.51 
 
 		 571 aa  142  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  32.18 
 
 		 351 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  36.73 
 
 		 345 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  33.58 
 
 		 317 aa  137  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  31.34 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  35.58 
 
 		 393 aa  128  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  31.14 
 
 		 335 aa  126  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  31.74 
 
 		 327 aa  123  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  35.96 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  33.69 
 
 		 482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  27.38 
 
 		 865 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  30 
 
 		 389 aa  107  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  29.02 
 
 		 527 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  27.13 
 
 		 922 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  30.67 
 
 		 1316 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  32.4 
 
 		 427 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  30.19 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  32.06 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  29.17 
 
 		 375 aa  102  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  31.52 
 
 		 400 aa  101  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  30.74 
 
 		 594 aa  101  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  32.06 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  32.06 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  32.06 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  28.33 
 
 		 462 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  29.38 
 
 		 486 aa  99  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  30.56 
 
 		 427 aa  97.8  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  27.13 
 
 		 512 aa  97.4  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  27.74 
 
 		 501 aa  97.4  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  27.53 
 
 		 769 aa  94.7  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  31.71 
 
 		 427 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  31.36 
 
 		 427 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  31.36 
 
 		 427 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  31.36 
 
 		 427 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  31.36 
 
 		 427 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  31.36 
 
 		 427 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  31.36 
 
 		 427 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  31.36 
 
 		 427 aa  90.5  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  31.64 
 
 		 427 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  28.24 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  26.82 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  27.76 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  27.57 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  28.2 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  28.97 
 
 		 919 aa  78.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  26.3 
 
 		 554 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  25.5 
 
 		 314 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  27.16 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  26.28 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  26.67 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  25.72 
 
 		 314 aa  73.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  30.9 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  25.56 
 
 		 1409 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  26.97 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  24.67 
 
 		 991 aa  71.2  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  27.95 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4090  pectinesterase  32.99 
 
 		 469 aa  70.1  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169247  normal  0.786788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  28.37 
 
 		 374 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  28.07 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  27.87 
 
 		 375 aa  66.6  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  25.99 
 
 		 374 aa  67  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  25.97 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  26.98 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  25.69 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  25.97 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  27.45 
 
 		 436 aa  63.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  26.87 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  24.72 
 
 		 405 aa  63.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  27.27 
 
 		 374 aa  62  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>