110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1412 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
874 aa  1664    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  42.23 
 
 
897 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  42.29 
 
 
873 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  39.15 
 
 
890 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  39.47 
 
 
890 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  39.4 
 
 
848 aa  293  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 
902 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 
880 aa  255  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  35.06 
 
 
811 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  33.33 
 
 
595 aa  231  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 
811 aa  229  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  37.53 
 
 
905 aa  203  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  30.89 
 
 
883 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
916 aa  135  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  33.65 
 
 
751 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  32.54 
 
 
689 aa  127  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  34.85 
 
 
861 aa  115  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  33.59 
 
 
717 aa  113  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  33.44 
 
 
814 aa  112  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.76 
 
 
2741 aa  103  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.76 
 
 
2741 aa  102  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 
729 aa  86.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  24.53 
 
 
532 aa  84.7  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  24.08 
 
 
959 aa  84.7  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  27.33 
 
 
893 aa  84  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 
846 aa  78.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
1162 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.54 
 
 
1162 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.34 
 
 
1007 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  31.2 
 
 
827 aa  72.8  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 
1060 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  37.68 
 
 
1051 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  25 
 
 
918 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  37.86 
 
 
1142 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  21.71 
 
 
1009 aa  68.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 
1409 aa  68.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
854 aa  65.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  34.69 
 
 
1077 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
994 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
1544 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
868 aa  65.1  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
1365 aa  64.7  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  32.61 
 
 
447 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
937 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
1621 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  25.51 
 
 
891 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  25.91 
 
 
845 aa  62.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 
1276 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  19.91 
 
 
884 aa  62.4  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  29.93 
 
 
809 aa  61.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.5 
 
 
991 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  24.37 
 
 
944 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
1779 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 
1711 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 
928 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
1247 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
883 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  28.37 
 
 
903 aa  58.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.32 
 
 
828 aa  58.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.94 
 
 
854 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  30 
 
 
521 aa  58.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  30.35 
 
 
371 aa  57.4  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  26.85 
 
 
840 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  33.75 
 
 
1096 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
851 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.16 
 
 
968 aa  56.6  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  30.77 
 
 
1246 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5663  hypothetical protein  31.86 
 
 
960 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.937261  normal  0.177848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  27.41 
 
 
1241 aa  55.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  27.27 
 
 
960 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  23.4 
 
 
1328 aa  55.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 
851 aa  54.7  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  24.66 
 
 
992 aa  54.7  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
868 aa  54.3  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
1261 aa  54.3  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  35.16 
 
 
1104 aa  54.3  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  31.78 
 
 
1228 aa  54.3  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  26.51 
 
 
853 aa  53.9  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  26.2 
 
 
1266 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  31.93 
 
 
1914 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  24.22 
 
 
919 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  33.59 
 
 
1025 aa  52.4  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  24.06 
 
 
877 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  32.85 
 
 
643 aa  51.6  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
1054 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.67 
 
 
2637 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
1055 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  25.58 
 
 
950 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
796 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1036 aa  49.3  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  34.87 
 
 
1441 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  24.44 
 
 
698 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  25.58 
 
 
950 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.77 
 
 
3299 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  36.9 
 
 
1475 aa  48.1  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  30.26 
 
 
1147 aa  48.5  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.7 
 
 
1650 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  25.85 
 
 
1051 aa  47.8  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  19.45 
 
 
909 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.69 
 
 
904 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>