227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2627 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  422  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  46.8 
 
 		 203 aa  203  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 203 aa  121  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 207 aa  117  7.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  98.6  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  25.57 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  24.02 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  24.1 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  24.63 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  26.84 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  25.71 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  24.66 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 332 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 291 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  35.8 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  29.79 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  28.05 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 257 aa  45.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  20.65 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 385 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 238 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 174 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 185 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 193 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  25 
 
 		 112 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>