More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06310 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  336  9e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  47.71 
 
 		 199 aa  128  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  54.69 
 
 		 186 aa  121  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 		 144 aa  110  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  42.14 
 
 		 193 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 194 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 244 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0927  transcriptional regulator, MarR family  41.72 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.708628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  45.1 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  39.6 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.1 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  39.02 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  43.82 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  36.54 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  37.76 
 
 		 287 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  33.64 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  36.56 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  33 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  36.08 
 
 		 292 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  35.62 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.58 
 
 		 312 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 142 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 167 aa  51.2  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 135 aa  50.8  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  50.8  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 307 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  23.57 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  36.07 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  36.07 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  36.78 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  39.51 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  25.55 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 189 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  30.19 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 203 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  37.04 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>