More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2976 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 190 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  64.55 
 
 		 195 aa  266  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  56.59 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 193 aa  199  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  52.72 
 
 		 189 aa  198  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  50.54 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  50.28 
 
 		 191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 235 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  43.16 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2022  isochorismatase hydrolase  39.27 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  37.35 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  36.25 
 
 		 196 aa  88.6  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  32.46 
 
 		 222 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 213 aa  84.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  33.96 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  32.62 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  31.94 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  29.26 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  32.96 
 
 		 274 aa  78.2  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 		 240 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  31.21 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  25.56 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  33.99 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 227 aa  72  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  26.53 
 
 		 313 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  30.13 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  26.49 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  28.02 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  25.64 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  28.04 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.73 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  30.41 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 240 aa  67.8  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  25.91 
 
 		 316 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  28.82 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  28.5 
 
 		 228 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.85 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  25.13 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  26.98 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  28.82 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  27.65 
 
 		 172 aa  67  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  29.76 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  27.62 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  27.62 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  25.79 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  25.3 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  31.45 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  30.17 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  30.17 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  30.17 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>