More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0008 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
775 aa  1564  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21042e-11 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  48.77 
 
 
728 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  50.15 
 
 
732 aa  618  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  50.82 
 
 
734 aa  616  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  48.99 
 
 
714 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  50 
 
 
734 aa  606  1e-172  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  50.16 
 
 
735 aa  607  1e-172  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  50.92 
 
 
714 aa  602  1e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  47.4 
 
 
728 aa  598  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  50.08 
 
 
727 aa  597  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  46.86 
 
 
727 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  49.92 
 
 
720 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  50.33 
 
 
739 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  50.56 
 
 
757 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  49.1 
 
 
770 aa  574  1e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  47.6 
 
 
720 aa  572  1e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  46.89 
 
 
741 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  51.76 
 
 
651 aa  561  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  49.34 
 
 
730 aa  556  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  49.15 
 
 
779 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  46.9 
 
 
763 aa  558  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  49.83 
 
 
750 aa  554  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  48.07 
 
 
833 aa  552  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  49.06 
 
 
776 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  49.48 
 
 
712 aa  551  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  47.66 
 
 
723 aa  547  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  48.48 
 
 
669 aa  514  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  45.93 
 
 
691 aa  512  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  46.34 
 
 
654 aa  507  1e-142  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  49.09 
 
 
796 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  47.51 
 
 
656 aa  474  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  47.48 
 
 
763 aa  468  1e-130  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  43.12 
 
 
714 aa  467  1e-130  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  47.21 
 
 
626 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  42.2 
 
 
768 aa  459  1e-128  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  46.96 
 
 
814 aa  462  1e-128  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  43.84 
 
 
712 aa  461  1e-128  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  48.21 
 
 
810 aa  460  1e-128  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  42.88 
 
 
718 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  43.05 
 
 
742 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  41.67 
 
 
759 aa  454  1e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  42.64 
 
 
744 aa  454  1e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  42.16 
 
 
757 aa  454  1e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  42.38 
 
 
769 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  46.67 
 
 
815 aa  452  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  45.94 
 
 
830 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  45.94 
 
 
830 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  46.61 
 
 
658 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  41.25 
 
 
724 aa  447  1e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  44.52 
 
 
760 aa  446  1e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  42.86 
 
 
750 aa  447  1e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  44.09 
 
 
759 aa  447  1e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  44.98 
 
 
707 aa  446  1e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  41.64 
 
 
758 aa  446  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  40.64 
 
 
724 aa  444  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  39.69 
 
 
764 aa  440  1e-122  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  40.3 
 
 
718 aa  441  1e-122  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  42.11 
 
 
765 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  41.53 
 
 
776 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  42.11 
 
 
784 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  42.11 
 
 
760 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  43.39 
 
 
743 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  46.32 
 
 
626 aa  432  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  40.23 
 
 
735 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  40.97 
 
 
729 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  44.98 
 
 
727 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  41.48 
 
 
732 aa  425  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  37.55 
 
 
831 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  39.83 
 
 
709 aa  422  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  41.2 
 
 
733 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  45.18 
 
 
750 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  37.55 
 
 
788 aa  422  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  40.32 
 
 
788 aa  418  1e-115  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  40.31 
 
 
712 aa  415  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  43.83 
 
 
728 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  43.46 
 
 
736 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  41.41 
 
 
776 aa  409  1e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  40.38 
 
 
755 aa  401  1e-110  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  42.19 
 
 
618 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  39.9 
 
 
626 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4055  peptidoglycan glycosyltransferase  38.35 
 
 
744 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  40.5 
 
 
712 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  40.97 
 
 
811 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  40.38 
 
 
751 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  44.16 
 
 
699 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  42.09 
 
 
824 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  42.09 
 
 
824 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  38.3 
 
 
680 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  39.37 
 
 
643 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  39.37 
 
 
643 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.94 
 
 
648 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  39.24 
 
 
668 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  38.71 
 
 
643 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  38.64 
 
 
658 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  40.21 
 
 
661 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  38.18 
 
 
727 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  39.29 
 
 
646 aa  360  5e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.46416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  38.96 
 
 
625 aa  357  3e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.58 
 
 
640 aa  355  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  36.9 
 
 
640 aa  353  6e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>