More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1232 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
750 aa  1531  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  66.38 
 
 
816 aa  1060  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  85.37 
 
 
909 aa  1174  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  48.83 
 
 
739 aa  678  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  40.69 
 
 
4489 aa  489  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  38.54 
 
 
1094 aa  491  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.16 
 
 
3560 aa  487  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  36.34 
 
 
3035 aa  468  1e-130  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  37.98 
 
 
761 aa  459  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 
1085 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 
654 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  33.28 
 
 
700 aa  402  1e-110  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  51.4 
 
 
395 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  38.42 
 
 
616 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  59.87 
 
 
685 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 
732 aa  378  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  59.62 
 
 
681 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
667 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 
618 aa  365  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  56.74 
 
 
637 aa  358  2e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  59.42 
 
 
612 aa  357  6e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 
611 aa  348  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  52.82 
 
 
362 aa  343  5e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
632 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  52.34 
 
 
865 aa  342  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
706 aa  333  7e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
660 aa  332  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
740 aa  329  1e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  56.48 
 
 
603 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
808 aa  316  8e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
647 aa  314  3e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.29 
 
 
1106 aa  314  4e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  32.57 
 
 
560 aa  313  8e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
1106 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  58.43 
 
 
583 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 
754 aa  300  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
750 aa  300  7e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  31.83 
 
 
680 aa  297  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
732 aa  295  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
569 aa  291  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  31.86 
 
 
585 aa  286  1e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 
708 aa  284  3e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
754 aa  284  4e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.96 
 
 
708 aa  283  7e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
789 aa  277  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
828 aa  275  2e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 
828 aa  274  5e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
828 aa  269  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 
718 aa  267  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
833 aa  263  9e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
833 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  34.12 
 
 
492 aa  262  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
633 aa  262  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
574 aa  261  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  32.71 
 
 
459 aa  258  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.93 
 
 
589 aa  257  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
590 aa  255  2e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  28.47 
 
 
590 aa  256  2e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
1714 aa  252  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
968 aa  251  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
824 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  27.76 
 
 
568 aa  249  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  37.71 
 
 
632 aa  248  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.93 
 
 
589 aa  246  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 
626 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  35.88 
 
 
657 aa  244  4e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
627 aa  244  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  35 
 
 
657 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.26 
 
 
667 aa  242  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  36.01 
 
 
566 aa  241  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  32.2 
 
 
637 aa  239  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  35.8 
 
 
452 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
789 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.82 
 
 
570 aa  237  5e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  33.51 
 
 
633 aa  237  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  34.45 
 
 
630 aa  235  2e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  42.29 
 
 
295 aa  234  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  4.90816e-07  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
598 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.14 
 
 
742 aa  229  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
647 aa  228  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
619 aa  227  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
672 aa  226  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
734 aa  224  5e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 
595 aa  224  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  25.92 
 
 
715 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  32.4 
 
 
588 aa  221  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 
822 aa  221  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.61 
 
 
739 aa  220  9e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  24.62 
 
 
699 aa  219  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  47.1 
 
 
878 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.29 
 
 
739 aa  217  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  44.87 
 
 
594 aa  216  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 
693 aa  216  1e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
796 aa  214  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.35 
 
 
810 aa  214  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  57.56 
 
 
430 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  25.86 
 
 
937 aa  210  9e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  32.01 
 
 
624 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
713 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.73 
 
 
529 aa  209  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>