More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2458 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  100 
 
 
500 aa  972    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  76.54 
 
 
500 aa  730    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  37.8 
 
 
485 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  38.7 
 
 
486 aa  280  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  34.97 
 
 
518 aa  268  2e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  34.86 
 
 
538 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  35.55 
 
 
499 aa  263  6.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  36.25 
 
 
485 aa  261  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  33.46 
 
 
554 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  33.98 
 
 
498 aa  251  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  34.52 
 
 
468 aa  246  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  33.73 
 
 
490 aa  246  8e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  35.94 
 
 
481 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  30.1 
 
 
462 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  34.4 
 
 
454 aa  243  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  34.16 
 
 
525 aa  239  9e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  32.75 
 
 
500 aa  236  8e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  34.75 
 
 
470 aa  226  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  31.94 
 
 
505 aa  219  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  30.42 
 
 
467 aa  217  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  30.66 
 
 
455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  31.68 
 
 
445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  29.96 
 
 
448 aa  213  5.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.47 
 
 
460 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  29.61 
 
 
461 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  31.71 
 
 
466 aa  194  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  29.56 
 
 
477 aa  192  9e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  29.96 
 
 
496 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  30.2 
 
 
461 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  30.26 
 
 
492 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  29.22 
 
 
463 aa  187  5e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  29.26 
 
 
475 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  28.9 
 
 
464 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  29.98 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
470 aa  172  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  26.32 
 
 
469 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
467 aa  169  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.12 
 
 
453 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.85 
 
 
453 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.7 
 
 
475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
469 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  26.11 
 
 
469 aa  167  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  25.85 
 
 
469 aa  166  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  26.37 
 
 
469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  26.37 
 
 
469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.27 
 
 
469 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  25.27 
 
 
469 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.27 
 
 
469 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.27 
 
 
469 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  25.27 
 
 
469 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  29.33 
 
 
458 aa  161  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  30.51 
 
 
483 aa  161  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.73 
 
 
460 aa  161  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.42 
 
 
475 aa  160  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  27.56 
 
 
448 aa  160  7e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.78 
 
 
454 aa  159  1e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  28.48 
 
 
453 aa  158  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  26.75 
 
 
503 aa  155  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.69 
 
 
462 aa  155  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  26.34 
 
 
453 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  27.29 
 
 
482 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.27 
 
 
453 aa  150  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.27 
 
 
463 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  26.05 
 
 
486 aa  149  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  26.71 
 
 
469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.25 
 
 
462 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  27.4 
 
 
524 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.07 
 
 
455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  28.91 
 
 
498 aa  146  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.32 
 
 
438 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  26.49 
 
 
469 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.6 
 
 
458 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
446 aa  144  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  27.7 
 
 
449 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  29.74 
 
 
480 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  26.46 
 
 
468 aa  143  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.99 
 
 
447 aa  143  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.79 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.79 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  26.26 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  26.79 
 
 
521 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.58 
 
 
458 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  28.34 
 
 
463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  29.13 
 
 
451 aa  141  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  28.12 
 
 
455 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  25.24 
 
 
457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
447 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  28.63 
 
 
465 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.75 
 
 
469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
452 aa  137  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  27.37 
 
 
478 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  26.46 
 
 
469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  27.94 
 
 
486 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  22.71 
 
 
456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  28.21 
 
 
503 aa  133  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>